ES2367430T3

ES2367430T3 - Anticuerpos contra pd-1 y sus usos.

Info

Publication number: ES2367430T3
Application number: ES03780521T
Authority: ES
Inventors: Mary Collins; Clive Wood; Beatriz Carreno; Viia Valge-Archer; Deborah Luxenberg; Jason Jussif; Caroline Russell; Laura K. CARTER; Frances Bennett; John Andrews
Original assignee: MedImmune Ltd; Wyeth LLC
Current assignee: MedImmune Ltd; Wyeth LLC
Priority date: 2002-12-23
Filing date: 2003-12-22
Publication date: 2011-11-03
Anticipated expiration: 2023-12-22
Also published as: CA2508660C; US20080311117A1; JP2006521783A; AU2003288675A8; CN101899114A; NO336442B1; NO20053389L; US8088905B2; CN1753912B; US20060210567A1; CA2508660A1; ATE514713T1; US20040213795A1; NO20053389D0; AU2003288675B2; US20100028330A1; AU2010235966A1; BR0316880A; AU2003288675A1; MXPA05006828A

Abstract

Un anticuerpo aislado o uno de sus fragmentos de unión al antígeno que comprende: Un dominio VH que comprende 3 CDRs; y un dominio VL que comprende 3 CDRs; en el que el anticuerpo comprende CDRs que tienen las secuencias de: (a) SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24 y SEQ ID NO: 25; y SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27 y SEQ ID NO: 28; o (b) SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 30 y SEQ ID NO: 31; y SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33 y SEQ ID NO: 34; o (c) SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36 y SEQ ID NO: 37 y SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39 y SEQ ID NO: 40; en el que el anticuerpo se une específicamente a un epítopo dentro del dominio extracelular del PD-1 humano.

Description

DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN

Campo de la invención [0001] El campo técnico se refiere a la modulación de las respuestas inmunitarias reguladas por el receptor de la muerte programada 1 (PD-1).

Antecedentes de la intención

[0002] Una respuesta inmunitaria adaptativa supone la activación, selección, y proliferación clonal de dos clases principales de linfocitos denominados células T y células B. Después de encontrarse con un antígeno, las células T proliferan y se diferencian en células efectoras específicas de antígeno, mientras que las células B proliferan y se diferencian en células que segregan anticuerpos.

[0003] La activación de las células T es un proceso multietapa que requiere varios eventos de señalización entre la célula T y una célula presentadora de antígenos (APC). Para que se produzca la activación de la célula T, se deben proporcionar dos tipos de señales a una célula T en reposo. El primer tipo está mediado por el receptor de células T específicas de antígeno (TcR), y confiere especificidad a la respuesta inmunitaria. El segundo tipo, de estimulación simultánea, regula la magnitud de la respuesta y se proporciona mediante receptores accesorios sobre las células T.

[0004] Se proporciona una señal de estimulación simultánea primaria mediante la activación del receptor CD28 tras el acoplamiento de sus ligandos B7-1 o B7-2. En contraste, el acoplamiento del receptor inhibidor CTLA-4 con los mismos ligandos B7-1 o B7-2 da como resultado la atenuación de la respuesta de las células T. Así, las señales de CTLA-4 antagonizan la estimulación simultánea mediada por CD28. A concentraciones de antígeno elevadas, la estimulación simultánea de CD28 anula el efecto inhibitorio de CTLA-4. La regulación temporal de la expresión de CD28 y CTLA-4 mantiene un equilibrio entre las señales de activación y de inhibición y asegura el desarrollo de una respuesta inmunitaria eficaz, mientras que al mismo tiempo protege contra el desarrollo de la autoinmunidad.

[0005] Recientemente se han identificado los homólogos moleculares de CD28 y CTLA-4 y sus ligandos similares a B-7. ICOS es un receptor de estimulación simultánea similar a CD28. El receptor PD-1 (muerte programada 1) es un receptor inhibitorio y equivalente a CTLA-4. Esta descripción se refiere a la modulación de respuestas inmunitarias mediadas por el receptor PD-1.

[0006] PD-1 es un receptor transmembrana de tipo I de 50-55 kDa que fue identificado originalmente en una línea de células T que experimentan la apoptosis inducida por activación. PD-1 se expresa en células T, células B, y macrófagos. Los ligandos para PD-1 son los miembros de la familia B7, PD-L1 (B7-H1) y PD-L2 (B7-DC).

[0007] PD-1 es un miembro de la superfamilia de las inmunoglobulinas (Ig) que contiene un solo dominio Ig de tipo V en su región extracelular. El dominio citoplasmático de PD-1 contiene dos tirosinas, con la tirosina más próxima a la membrana (VAYEEL en PD-1 de ratón) localizada en un ITIM (motivo inhibidor de un inmuno-receptor basado en tirosina). La presencia de un ITIM en PD-1 indica que esta molécula funciona para atenuar la señalización del receptor de antígenos por reclutamiento de fosfatasas citoplasmáticas. Las proteínas PD-1 humanas y murinas comparten una identidad en aminoácidos del 60% aproximadamente con la conservación de sitios de N-glicosilación potenciales, y restos que definen el dominio Ig-V. El ITIM que se encuentra en la región citoplasmática y el motivo similar a ITIM que rodea la tirosina carboxi-terminal (TEYATI en seres humanos y en ratón) también están conservados entre los ortólogos humanos y murinos.

[0008] PD-1 se expresa en células T, células B, y monocitos activados. Los datos experimentales relacionan las interacciones de PD-1 con sus ligandos en la regulación por defecto de las respuestas inmunitarias centrales y periféricas. En particular, la proliferación en células T de tipo silvestre se inhibe en presencia de PD-L1, pero no en células T deficientes en PD-1. Además, ratones deficientes en PD-1 presentan un fenotipo autoinmunitario. La deficiencia de PD-1 en ratones C57BL/6 da como resultado una glomerulonefritis y una artritis similar al lupus crónico progresivo. En ratones Balb/c, la deficiencia en PD-1 da lugar a cardiomiopatías severas debido a la presencia de anticuerpos auto-reactivos específicos del tejido cardiaco. Agata y col. (1996) describe un anticuerpo que se une al PD-1 de ratón. El documento WO 02/078731 describe la secuencia del PD-1 humano y anticuerpos que inhiben la interacción entre PD-L1 y PD-1.

[0009] En general, existe la necesidad de proporcionar procedimientos terapéuticos seguros y efectivos para trastornos inmunitarios tales como, por ejemplo, enfermedades autoinmunitarias, trastornos inflamatorios, alergias, rechazo de trasplantes, cáncer, deficiencias inmunitarias, y otros trastornos relacionados con el sistema inmunitario. La modulación de las respuestas inmunitarias involucradas en estos trastornos se puede conseguir con la manipulación de la vía del PD-1.

SUMARIO DE LA INVENCIÓN

[0010] La presente descripción proporciona anticuerpos que pueden actuar como agonistas y/o antagonistas de PD-1, modulando así las respuestas inmunitarias reguladas por PD-1. La descripción además proporciona anticuerpos contra PD-1 que comprenden nuevos fragmentos de unión a antígenos. Los anticuerpos contra PD-1 de la invención son capaces de (a) unirse específicamente a PD-1, incluyendo el PD-1 humano; (b) bloquear las interacciones de PD-1 con su(s) ligando(s) natural(es); o (c) desempeñar ambas funciones. Además, los anticuerpos pueden tener propiedades inmunomoduladoras, es decir, pueden ser eficaces en la modulación de la regulación por defecto asociada a PD-1 de respuestas inmunitarias. Dependiendo del procedimiento de uso y el efecto deseado, los anticuerpos se pueden usar para potenciar o inhibir respuestas inmunitarias.

[0011] Las formas de realización ilustrativas de los anticuerpos se denominan PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD135, y PD1-F2. Otras formas de realización comprenden un dominio VH y/o VL del fragmento Fv de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, o PD1-F2. Formas de realización adicionales comprenden una o más regiones determinantes de complementariedad (CDRs) de cualquiera de estos dominios VH y VL. Otras formas de realización comprenden un fragmento H3 del dominio VH de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, o PD1-F2.

[0012] La descripción también proporciona composiciones que comprenden anticuerpos PD-1, y su uso en procedimientos de modulación de la respuesta inmunitaria, incluyendo procedimientos para el tratamiento de seres humanos o animales. En formas de realización particulares, los anticuerpos contra PD-1 se usan para tratar o prevenir trastornos inmunitarios incrementando o reduciendo la respuesta de las células T mediada por TcR/CD28. Los trastornos susceptibles al tratamiento con las composiciones de la invención incluyen, pero no están limitados a, artritis reumatoide, esclerosis múltiple, enfermedad inflamatoria del intestino, enfermedad de Crohn, lupus eritematoso sistémico, diabetes de tipo I, rechazo de trasplantes, enfermedad de injerto contra hospedador, trastornos inmunitarios hiperproliferativos, cáncer, y enfermedades infecciosas.

[0013] Además, los anticuerpos contra PD-1 se pueden usar en diagnosis para detectar PD-1 o sus fragmentos en una muestra biológica. La cantidad de PD-1 detectada puede estar relacionada con el nivel de expresión de PD-1, que a su vez, está relacionado con el estado de activación de las células inmunitarias (por ejemplo, células T, células B, y monocitos activados) en el sujeto.

[0014] La descripción también proporciona ácidos nucleicos aislados, que comprenden una secuencia que codifica un dominio VH o VL procedente del fragmento Fv de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, o PD1-F2. También se proporcionan ácidos nucleicos aislados, que comprenden una secuencia que codifica una o más CDRs procedente de cualquiera de los dominios VH y VL descritos en el presente documento. La descripción también proporciona vectores y células hospedadoras que comprenden dichos ácidos nucleicos.

[0015] La descripción adicionalmente proporciona un procedimiento de producción de nuevos dominios VH y VL y/o anticuerpos funcionales que comprenden todos o una parte de dichos dominios derivados de los dominios VH

o VL de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, o PD1-F2.

[0016] Aspectos adicionales de la exposición se desarrollarán en parte en la siguiente descripción, y en parte serán obvios a partir de la descripción, o se pueden conocer poniendo en práctica la invención. La invención se desarrolla y se concreta particularmente en las reivindicaciones anexas, y la presente exposición no se debe interpretar en ningún modo como una limitación del alcance de las reivindicaciones. La presente descripción detallada incluye representaciones ejemplares de diversas formas de realización de la invención, que no suponen una restricción de la misma, como se ha indicado. Las Figuras acompañantes constituyen una parte de esta memoria descriptiva y, junto con la descripción, sirven para ilustrar diversas formas de realización de la invención.

BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS [0017] Las Figuras 1A y 1B muestra la reactividad de anticuerpos scFv con el PD-1 humano determinado mediante ELISA de fagos.

[0018] Las Figuras 2A-2C muestran la reactividad de anticuerpos convertidos por IgG con el PD-1 humano o de ratón determinado mediante ELISA.

[0019] La Figura 3 presenta los resultados de un ELISA que demuestra que anticuerpos PD-1 seleccionados inhiben la unión de PD-L1 a PD-1.

[0020] La Figura 4 presenta los resultados de un ELISA que demuestra que anticuerpos PD-1 inmunomoduladores se unen a diferentes sitios sobre PD-1 según se determina mediante ensayos de ELISA de bloqueo cruzado.

[0021] La Figura 5 presenta los resultados de ensayos de proliferación de células T que demuestran que el acoplamiento simultáneo de TcR y el anticuerpo contra PD-1, PD1-17 o PD-L1.Fc reduce la proliferación. El acoplamiento simultáneo de TcR y el anticuerpo contra PD-1 J110 no tiene ningún efecto sobre la proliferación.

[0022] La Figura 6 demuestra una proliferación aumentada de células T primarias mediante PD1-17 en una forma soluble.

DESCRIPCIÓN DETALLADA

Definiciones

[0023] El término "anticuerpo", como se usa en esta descripción, se refiere a una inmunoglobulina o uno de sus fragmentos o derivados, y engloba cualquier polipéptido que comprenda un sitio de unión a antígenos, independientemente de si se ha producido in vitro o in vivo. El término incluye, pero no está limitado a, anticuerpos policlonales, monoclonales, monoespecíficos, poliespecíficos, no específicos, humanizados, de cadena sencilla, quiméricos, sintéticos, recombinantes, híbridos, mutados, e injertados. A menos que estén modificados de otra forma por el término "intacto", como en "anticuerpos intactos", para los propósitos de esta descripción, el término "anticuerpo" también incluye fragmentos de anticuerpos tales como Fab, F(ab')2, Fv, scFv, Fd, dAb, y otros fragmentos de anticuerpos que retengan la función de unión a antígenos, es decir, la capacidad para unirse específicamente a PD-1. Normalmente dichos fragmentos comprenderán un dominio de unión a antígenos.

[0024] Las expresiones "dominio de unión a antígenos", "fragmento de unión a antígenos", y "fragmento de unión" se refieren a una parte de una molécula de anticuerpo que comprende aminoácidos responsables de la unión específica entre el anticuerpo y el antígeno. En los casos en los que un antígeno sea grande, es posible que el dominio de unión a antígenos sólo se una a una parte del antígeno. La fracción de la molécula antigénica que es responsable de interacciones específicas con el dominio de unión a antígenos se denomina "epítopo" o "determinante antigénico".

[0025] Un dominio de unión a antígenos normalmente comprende la región variable de la cadena ligera (VL) de un anticuerpo y la región variable de la cadena pesada (VH) de un anticuerpo, no obstante, no tiene por qué contener necesariamente ambas. Por ejemplo, el fragmento de anticuerpo denominado Fd consta solamente de un dominio VH, pero aun así retiene parte de la función de unión al antígeno del anticuerpo intacto.

[0026] El término "repertorio" se refiere a una colección de nucleótidos genéticamente variada derivada completa o parcialmente de secuencias que codifican inmunoglobulinas expresadas. Las secuencias se generan mediante el reordenamiento in vivo de, por ejemplo, los segmentos V, D, y J de las cadenas H y, por ejemplo, los segmentos V y J de las cadenas L. Alternativamente, las secuencias se pueden generar a partir de una línea celular mediante estimulación in vitro, en respuesta a la cual se produce el reordenamiento. Alternativamente, parte o todas las secuencias se pueden obtener combinando, por ejemplo, segmentos V no reordenados con segmentos D y J, mediante síntesis de nucleótidos, mutagénesis aleatoria, y otros procedimientos, por ejemplo, como se describe en la patente de EE.UU. Nº 5.565.332.

[0027] Las expresiones "interacción específica" y "unión específica" se refieren a dos moléculas que forman un complejo que es relativamente estable en condiciones fisiológicas. La unión específica se caracteriza por una afinidad elevada y una capacidad de baja a moderada, a diferencia de la unión no especifica que normalmente tiene una baja afinidad con una capacidad de moderada a alta. Normalmente, la unión se considera específica cuando la constante de afinidad KA es superior a 106 M-1, o más preferentemente superior a 108 M-1. Si fuera necesario, la unión no específica se puede reducir sin afectar sustancialmente a la unión específica variando las condiciones de unión. El facultativo experto puede optimizar las condiciones de unión apropiadas tales como la concentración de anticuerpos, la fuerza iónica de la disolución, la temperatura, el tiempo que se deja para la unión, la concentración de agente de bloqueo (por ejemplo, seroalbúmina, caseína de la leche), etc., usando técnicas rutinarias. Condiciones ilustrativas se detallan en los Ejemplos 1, 2, 4, 6, y 7.

[0028] La frase "sustancialmente como se establece" significa que los dominios CDR, VH o VL pertinentes de la invención serán idénticos o presentan únicamente diferencias irrelevantes en las regiones especificadas (por ejemplo, una CDR), a la secuencia a partir de la cual se establecen. Diferencias irrelevantes incluyen cambios mínimos en los aminoácidos, tales como sustituciones de 1 ó 2 entre 5 aminoácidos cualesquiera en la secuencia de una región específica.

[0029] El término "actividad de PD-1" se refiere a una o más actividades inmunorreguladoras asociadas a PD

1. Por ejemplo, PD-1 es un regulador negativo de la respuesta inmunitaria mediada por TcR/CD28. En los Ejemplos 8, 9, y 10 se describen procedimientos para valorar la actividad in vivo e in vitro de PD-1.

[0030] Los términos "modular", "inmunomodulador" y sus cognados se refieren a una reducción o un incremento en la actividad de PD-1 asociada a la regulación por defecto de la respuesta de células T debido a su interacción con un anticuerpo contra PD-1, donde la reducción o el incremento es relativo a la actividad de PD-1 en ausencia del mismo anticuerpo. Una reducción o un incremento de la actividad es de, preferentemente, al menos el 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, o superior aproximadamente. Cuando se reduce la actividad de PD-1, los términos "modulador" y "modular" se pueden intercambiar con los términos "inhibitorio" e "inhibir". Cuando se incrementa la actividad de PD-1, los términos "modulador" y "modular" se pueden intercambiar con los términos "activante" y "activar". La actividad de PD-1 se puede determinar cuantitativamente usando ensayos de proliferación de células T como se describe en los Ejemplos 8 y 9.

[0031] Las expresiones "tratamiento" y "procedimiento terapéutico" se refieren tanto al tratamiento terapéutico como a medidas profilácticas/preventivas. Los sujetos que necesitan tratamiento pueden incluir individuos que ya presentan un trastorno médico particular así como aquellos que en última instancia pueden contraer la enfermedad (es decir, aquellos que necesitan medidas preventivas).

[0032] La expresión "cantidad eficaz" se refiere a una dosificación o cantidad que es suficiente para reducir la actividad de PD-1 hasta que se produzca una mejora de los síntomas en un paciente o se consiga un resultado biológico deseado como por ejemplo, el incremento de la actividad citolítica de las células T, la inducción de tolerancia inmunitaria, la reducción o el incremento de la actividad de PD-1 asociada a la regulación negativa de la respuesta inmunitaria mediada por células T, etc.

[0033] El término "aislado" se refiere a una molécula que se encuentra sustancialmente exenta de su entorno natural. Por ejemplo, una proteína aislada está sustancialmente exenta de material celular u otras proteínas procedentes de la célula o la fuente tisular de la cual procede. El término "aislado" también se refiere a preparaciones en las que la proteína aislada está suficientemente pura para que se pueda administrar en forma de composición farmacéutica, o al menos un 70 -80% (p/p) pura, más preferentemente al menos un 80-90% (p/p) pura, incluso más preferentemente, un 90-95% pura; y lo más preferentemente, al menos un 95%, 96%, 97%, 98%, 99%,

o 100% (p/p) pura.

Anticuerpos contra PD-1

[0034] La descripción proporciona anticuerpos contra PD-1 que comprenden nuevos fragmentos de unión a antígenos.

[0035] En general, los anticuerpos se pueden preparar, por ejemplo, usando técnicas de hibridoma tradicionales (Kohler y Milstein (1975) Nature, 256: 495-499), procedimientos de ADN recombinante (patente de EE.UU. Nº 4.816.567), o presentación de fagos llevada a cabo con librerías de anticuerpos (Clackson y col. (1991) Nature, 352: 624-628; Marks y col. (1991) J. Mol. Biol., 222: 581-597). Para otras técnicas de producción de anticuerpos, véase también Antibodies: A Laboratory Manual, eds. Harlow y col., Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. La invención no está limitada a ninguna fuente, especie de origen, o procedimiento de producción particular.

[0036] Los anticuerpos intactos, también conocidos como inmunoglobulinas, normalmente son proteínas glicosiladas tetraméricas compuestas de dos cadenas ligeras (L) de 25 kDa aproximadamente y dos cadenas pesadas (H) de 50 kDa aproximadamente cada una. En los anticuerpos se encuentran dos tipos de cadena ligera, denominadas cadena λ y cadena κ. Dependiendo de la secuencia de aminoácidos del dominio constante de las cadenas pesadas, las inmunoglobulinas se pueden asignar a cinco clases principales: A, D, E, G, y M, y algunas de éstas se pueden dividir a su vez en subclases (isotipos), por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, e IgA2.

[0037] Las estructuras subunitarias y configuraciones tridimensionales de diferentes clases de inmunoglobulinas son muy conocidas en la materia. Para una revisión de la estructura de los anticuerpos, véase Harlow y col., supra. En resumen, cada cadena ligera está compuesta de un dominio variable N-terminal (VL) y un dominio constante (CL). Cada cadena pesada está compuesta de un dominio variable N-terminal (VH), tres o cuatro dominios constantes (CH), y una región bisagra. El dominio CH más próximo a VH se denomina CH1. Los dominios VH y VL constan de cuatro regiones con una secuencia relativamente conservada denominadas regiones marco (FR1, FR2, FR3, y FR4), que forman el andamio para tres regiones de secuencia hípervariable denominadas regiones determinantes de complementariedad (CDRs). Las CDRs contienen la mayoría de restos responsables de las interacciones específicas con el antígeno. Las tres CDRs se denominan CDR1, CDR2, y CDR3. Los constituyentes de las CDR de la cadena pesada se denominan H1, H2, y H3, mientras que los constituyentes de las CDR de la

5 cadena ligera se denominan, por tanto, L1, L2, y L3. CDR3 y, particularmente H3, son la fuente principal de diversidad molecular dentro del dominio de unión al antígeno. Por ejemplo, H3 puede constar de sólo dos restos aminoácidos o contener más de 26.

[0038] El fragmento Fab (fragmento de unión al antígeno) consta de los dominios VH-CH1 y VL-CL unidos

10 covalentemente por un enlace disulfuro entre las regiones constantes. Para vencer la tendencia de los dominios VH y VL no unidos covalentemente en la Fv a disociarse cuando se expresan simultáneamente en una célula hospedadora, se puede construir el denominado fragmento Fv de cadena sencilla (sc), fragmento scFv. En un scFv, un polipéptido flexible y convenientemente largo que une el C-término de la VH al N-término de la VL o el C-término de la VL al N-término de la VH. Más habitualmente, se usa un péptido (Gly4Ser)3 de 15 restos como enlazador, pero

15 en la materia también se conocen otros enlazadores.

[0039] La diversidad de los anticuerpos es el resultado del ensamblaje combinatorio de múltiples genes de la línea germinal que codifican regiones variables y una variedad de eventos somáticos. Los eventos somáticos incluyen la recombinación de segmentos génicos variables con segmentos génicos de diversidad (D) y de unión (J)

20 para producir una región VH completa y la recombinación de segmentos génicos variables y de unión para producir una región VL completa. El proceso de recombinación es impreciso en sí mismo, dando como resultado la pérdida o adición de aminoácidos en las uniones V(D)J. Estos mecanismos de diversidad se producen en las células B en desarrollo antes de la exposición a antígenos. Después de la estimulación antigénica, los genes de los anticuerpos expresados en las células B experimentan una mutación somática.

25 [0040] Basándose en el número estimado de segmentos génicos de la línea germinal, con la recombinación aleatoria de estos segmentos, y el apareamiento aleatorio de VH-VL, se pueden producir hasta 1,6 x 107 anticuerpos diferentes (Fundamental Immunology, 3rd ed., ed. Paul, Raven Press, Nueva York, NY, 1993). Cuando se tienen en cuenta otros procesos que contribuyen a la diversidad de los anticuerpos (tal como la mutación somática), se piensa

30 que potencialmente se pueden generar por encima de 1 x 1010 anticuerpos diferentes (Immunoglobulin Genes, 2nd ed., eds. Jonio y col., Academic Press, San Diego, CA, 1995). Debido a los numerosos procesos involucrados en la diversidad de los anticuerpos, es altamente improbable que anticuerpos generados de manera independiente tengan una secuencia de aminoácidos idéntica o incluso sustancialmente similar en las CDRs.

35 [0041] La descripción proporciona nuevas CDRs procedentes de librerías génicas de inmunoglobulinas humanas. La estructura que lleva una CDR generalmente será una cadena pesada o ligera de un anticuerpo o una parte de las mismas, en la que la CDR está localizada en el sitio correspondiente a la CDR de las VH y VL de origen natural. Las estructuras y localizaciones de los dominios variables de las inmunoglobulinas se pueden determinar, por ejemplo, como se describe en Kabat y col., Sequences of Proteins of Immunological Interest, No. 91-3242,

40 National Institutes of Health Publications, Bethesda, MD, 1991.

[0042] El ADN y las secuencias de aminoácidos de anticuerpos contra PD-1, su fragmento scFv, los dominios VH y VL, y las CDRs se exponen en el Listado de secuencias y se enumeran en forma de lista en la Tabla 1. Formas de realización ilustrativas no limitantes particulares de los anticuerpos se denominan PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1

45 35, y PD1-F2. Las posiciones de cada CDR dentro de los dominios VH y VL de las formas de realización ilustrativas se listan en las Tablas 2 y 3.

Tabla 1: ADN y secuencias de aminoácidos (AA) de los dominios VH y VL y las CDRs Tabla 2: Posiciones de las CDRs en las cadenas pesadas

Secuencia: PD1-17 PD1-28 PD1-33 PD1-35 PD1-F2

VH ADN: SEQ ID NO: 1 SEQ ID NO: 5 SEQ ID NO: 9 SEQ ID NO: 13 SEQ ID NO: 46

VH AA: SEQ ID NO: 2 SEQ ID NO: 6 SEQ ID NO: 10 SEQ ID NO: 14 SEQ ID NO: 47

VL ADN: SEQ ID NO: 3 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 15 SEQ ID NO: 48

VL AA: SEQ ID NO: 4 SEQ ID NO: 8 SEQ ID NO: 12 SEQ ID NO: 16 SEQ 10 NO:49

H1 AA: SEQ ID NO: 17 SEQ ID NO: 23 SEQ ID NO: 29 SEQ ID NO: 35 SEQ 10 NO:50

H2 AA: SEQ ID NO: 18 SEQ ID NO: 24 SEQ ID NO: 30 SEO ID NO: 36 SEQ 10 NO:51

H3 AA: SEQ ID NO: 19 SEQ ID NO: 25 SEQ ID NO: 31 SEQ ID NO: 37 SEQ 10 NO:52

L1AA: SEQ ID NO: 20 SEQ ID NO: 26 SEQ ID NO: 32 SEQ ID NO: 38 SEQ ID NO: 53

L2 AA: SEQ ID NO: 21 SEQ ID NO: 27 SEQ ID NO: 33 SEQ ID NO: 39 SEQ ID NO: 54

L3 AA: SEQ ID NO: 22 SEQ ID NO: 28 SEQ ID NO: 34 SEQ ID NO: 40 SEQ ID NO: 55

CDR: PD1-17 SEQ ID NO: 2 PD1-28 SEQ ID NO: 6 PD1-33 SEQ ID NO: 10 PD1-35 SEQ ID NO: 14 PD1-F2 SEQ ID NO: 47

H1: 31-42 31-35 31-35 31-37 34-42

H2: 57-72 50-66 50-66 52-67 57-73

H3: 105-117 99-108 99-108 100-116 106-114

Tabla 3: Posiciones de las CDRs en las cadenas ligeras

CDR: PD1-17 SEQ ID NO: 4 PD1-28 SEQ ID NO: 8 PD1-33 SEQ ID NO: 12 PD1-35 SEQ ID NO: 16 PD1-F2 SEQ ID NO: 49

L1: 23-35 23-33 23-36 23-35 28-35

L2: 51-57 49-55 52-58 51-57 54-61

L3: 92-100 88-98 91-102 90-100 94-101

5 [0043] Los anticuerpos contra PD-1 opcionalmente pueden comprender regiones constantes del anticuerpo o partes de las mismas. Por ejemplo, un dominio VL puede tener unido, en su C-término, dominios constantes de la cadena ligera del anticuerpo, incluyendo las cadenas Cκ o Cλ. De manera similar, un dominio de unión al antígeno específico basado en un dominio VH puede tener unido toda o parte de una cadena pesada de la inmunoglobulina

10 derivada de cualquier isótopo de un anticuerpo, por ejemplo, IgG, IgA, IgE, y IgM y cualquiera de las subclases isotípicas, que incluyen pero no están limitadas a, IgG1 e IgG4. En las formas de realización de ejemplo, PD1-17, PD1-28, PD1-33, y PD1-35, los anticuerpos comprenden fragmentos C-terminales de las cadenas ligera y pesada de la IgG1λ humana, mientras que PD1-F2 comprende fragmentos C-terminales de las cadenas ligera y pesada de la IgG1κ humana. El ADN y las secuencias de aminoácidos para el fragmento C-terminal son muy conocidos en la

15 materia (véase, por ejemplo, Kabat y col., Sequences of Proteins of Immunological Interest, No. 91-3242, National Institutes of Health Publications, Bethesda, MD, 1991). Secuencias de ejemplo no limitantes se exponen en la Tabla

4.

Tabla 4

Región C-terminal: ADN Aminoácido

Cadena pesada de IgG1: SEQ ID NO: 44 SEQ ID NO: 45

Cadena ligera λ: SEQ ID NO: 42 SEQ ID NO: 43

Cadena ligera κ: SEQ ID NO: 57 SEQ ID NO: 58

20 [0044] Ciertas formas de realización comprenden un dominio VH y/o VL de un fragmento Fv procedente de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, y PD1-F2. Formas de realización adicionales comprenden al menos una CDR de cualquiera de estos dominios VH y VL. Los anticuerpos, que comprenden al menos una de las secuencias de las CDR expuestas en la SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NOs: 16-40, SEQ ID NO: 47, o SEQ ID NO: 49 están comprendidos dentro del alcance de

25 esta invención. Una forma de realización, por ejemplo, comprende un fragmento H3 del dominio VH de anticuerpos seccionados a partir de al menos uno de PD1-17, PD1-28, PD1-33, PD1-35, y PD1-F2.

[0045] En ciertas formas de realización, los dominios VH y/o VL se pueden convertir a la línea germinal, es decir, las regiones marco (FRs) de estos dominios se mutan usando técnicas de biología molecular convencionales

30 para emular a los producidos por las células de la línea germinal. En otras formas de realización, las secuencias marco permanecen divergentes de las secuencias de la línea germinal consenso.

[0046] En ciertas formas de realización, los anticuerpos se unen específicamente a un epítopo dentro del dominio extracelular del PD-1 humano. El dominio extracelular predicho consta de una secuencia de entre 21 35 aminoácidos aproximadamente y 170 aminoácidos aproximadamente de la SEQ ID NO: 41 (Nº de acceso de Swissport Q15116). En ciertas formas de realización, los anticuerpos se unen específicamente a un epítopo dentro del dominio extracelular del PD-1 de ratón, con una afinidad superior a 107 M-1, y preferentemente superior a 108 M-1. La secuencia de aminoácidos del PD-1 de ratón se expone en la SEQ ID NO: 56 (Nº de acceso NM_008798) y es en su conjunto idéntica en un 60% aproximadamente a su homólogo humano. En formas de realización adicionales, los

40 anticuerpos de la invención se unen al dominio de unión PD-L de PD-1.

[0047] También está contemplado que los anticuerpos de la invención se puedan unir a otras proteínas, incluyendo, por ejemplo, proteínas recombinantes que comprenden todo o una porción del dominio extracelular de PD-1.

45 [0048] La persona con conocimientos ordinarios en la materia reconocerá que los anticuerpos de esta invención se pueden usar para detectar, medir, e inhibir proteínas que difieran algo de PD-1. Se espera que los anticuerpos retengan la especificidad de unión siempre que la proteína diana comprenda una secuencia que sea al menos un 60%, 70%, 80%, 90%, 95% idéntica aproximadamente, o superior, a cualquier secuencia de al menos 100, 80, 60, 40, ó 20 aminoácidos contiguos en la secuencia expuesta SEQ ID NO: 41. El porcentaje de identidad se determina mediante algoritmos de alineamiento habituales tales como, por ejemplo, Basic Local Alignment Tool (BLAST) descrito en Altshul y col. (1990) J. Mol. Biol., 215: 403-410, el algoritmo de Needleman y col. (1970) J. Mol. Biol., 48: 444-453, o el algoritmo de Meyers y col. (1988) Comput. Appl. Biosci., 4: 11-17.

[0049] Además de los análisis de homología de secuencia, se puede llevar a cabo el mapeo de epítopos (véase, por ejemplo, Epitope Mapping Protocols, ed. Morris, Humana Press, 1996) y análisis de la estructura secundaria y terciaria para identificar estructuras tridimensionales específicas asumidas por los anticuerpos descritos y sus complejos con antígenos. Dichos procedimientos incluyen, pero no están limitados a, cristalografía con rayos X (Engstom (1974) Biochem. Exp. Biol., 11:7-13) y modelización por ordenador de representaciones virtuales de los anticuerpos descritos en el presente documento (Fletterick y col. (1986) Computer Graphics and Molecular Modeling, en Current Communications in Molecular Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY).

Derivados

[0050] Esta descripción también proporciona un procedimiento para la obtención de un anticuerpo específico para PD-1. Las CDRs en dichos anticuerpos no están limitadas a las secuencias específicas de VH y VL identificadas en la Tabla 1 y pueden incluir variantes de estas secuencias que retengan la capacidad para unirse específicamente a PD-1. Dichas variantes se pueden obtener a partir de las secuencias listadas en la Tabla 1 por el facultativo experto usando técnicas conocidas en la materia. Por ejemplo, se pueden realizar sustituciones, eliminaciones, o adiciones de aminoácidos en las FRs y/o en las CDRs. A pesar de que normalmente los cambios en las FRs están diseñados para mejorar la estabilidad e inmunogenicidad del anticuerpo, los cambios en las CDRs normalmente están diseñados para incrementar la afinidad del anticuerpo por su diana. Las variantes de las FRs también incluyen alotipos de inmunoglobulinas de origen natural. Dichos cambios que incrementan la afinidad se pueden determinar empíricamente mediante técnicas rutinarias que suponen la alteración de la CDR y la comprobación de la afinidad del anticuerpo por su diana. Por ejemplo, se pueden realizar sustituciones conservativas de aminoácidos dentro de cualquiera de las CDRs descritas. Se pueden introducir diversas alteraciones según los procedimientos descritos enAntibody Engineering, 2nd ed., Oxford University Press, ed. Borrebaeck, 1995. Éstas incluyen, pero no están limitados a, secuencias de nucleótidos que están alteradas por la sustitución de diferentes codones que codifican un resto aminoácido funcionalmente equivalente dentro de la secuencia, produciendo así un cambio "silencioso". Por ejemplo, los aminoácidos no polares incluyen alanina, leucina, isoleucina, valina, prolina, fenilalanina, triptófano, y metionina. Los aminoácidos neutros polares incluyen glicina, serina, treonina, cisteína, tirosina, asparagina, y glutamina. Los aminoácidos cargados positivamente (básicos) incluyen arginina, lisina, e histidina. Los aminoácidos cargados negativamente (ácidos) incluyen ácido aspártico y ácido glutámico. Los sustitutos para un aminoácido dentro de la secuencia se pueden seleccionar entre otros miembros de la clase a la que pertenece el aminoácido (véase Tabla 5). Además, cualquier resto nativo en el polipéptido también se puede sustituir con alanina (véase, por ejemplo, MacLennan y col. (1998) Acta Physiol. Scand. Suppl. 643:55-67; Sasaki y col. (1998) Adv. Biophys. 35:124).

[0051] Los derivados y análogos de anticuerpos de la invención se pueden producir mediante diversas técnicas muy conocidas en la materia, incluyendo procedimientos sintéticos y recombinantes (Maniatis (1990) Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, y Bodansky y col. (1995) The Practice of Peptide Synthesis, 2nd ed., Spring Verlag, Berlín, Alemania).

Tabla 5

Restos originales: Substituciones de ejemplos Substituciones típicas

Ala (A): Val, Leu, Ile Val

Arg (R): Lys, Gln, Asn Lys

Asn (N): Gln Gln

Asp (D): Glu Glu

Cys (C): Ser, Ala Ser

Gln (Q): Asn Asn

Gly (G): Pro, Ala Ala

His (H): Asn, Gln, Lys, Arg Arg

Ile (I): Leu, Val, Met, Ala, Phe, Norleucina Leu

Leu (L): Norleucina, Ile, Val, Met, Ala, Phe Ile

Lys (K): Arg, Ácido 1,4-diamino-butírico, Gln, Asn Arg

Met (M): Leu, Phe, Ile Leu

Phe (F): Leu, Val, Ile, Ala, Tyr Leu

Pro (P): Ala Gly

Ser (S): Thr, Ala, Cys Thr

Thr (T): Ser Ser

Trp (W): Tyr, Phe Tyr

Tyr (Y): Trp, Phe, Thr, Ser Phe

Val (V): Ile, Met, Leu, Phe, Ala, Norleucina Leu

[0052] En una forma de realización, un procedimiento para la preparación de un dominio VH que es una

5 variante de una secuencia de aminoácidos de un dominio VH de la invención comprende una etapa de adición, eliminación, sustitución, o inserción de uno o más aminoácidos en la secuencia de aminoácidos del dominio VH descrito en el presente documento, opcionalmente la combinación del dominio VH así producido con uno o más dominios VL, y someter a prueba el dominio VH o la combinación o combinaciones VH/VL para una unión específica a PD-1 y/o, opcionalmente, someter a prueba la capacidad de dicho dominio de unión al antígeno para modular la

10 actividad de PD-1. El dominio VL puede tener una secuencia de aminoácidos que sea idéntica o sustancialmente como la expuesta en la Tabla 1.

[0053] Se puede emplear un procedimiento análogo en el que una o más variantes de secuencia de un dominio VL descrito en el presente documento se combinan con uno o más dominios VH.

15 [0054] Un aspecto adicional de la descripción proporciona un procedimiento de preparación de un fragmento de unión al antígeno que se une específicamente a PD-1. El procedimiento comprende:

(a) el suministro de un repertorio de ácidos nucleicos de partida que codifican un dominio VH que incluye una CDR3 20 a reemplazar o carece de una región que codifica CDR3;

(b) la combinación del repertorio con un ácido nucleico donador que codifica una secuencia de aminoácidos sustancialmente como la expuesta en el presente documento para una CDR3 de VH (es decir, H3) de manera que el ácido nucleico donador se inserte dentro de la región CDR3 en el repertorio, para así proporcionar un repertorio

25 producto de ácidos nucleicos que codifican un dominio VH;

(c) la expresión de los ácidos nucleicos del repertorio producto;

(d) la selección de un fragmento de unión específico para PD-1; y 30

(e) la recuperación del fragmento de unión específico o del ácido nucleico que lo codifica.

[0055] De nuevo, se puede emplear un procedimiento análogo en el que una CDR3 de VL (es decir, L3) de la invención se combina con un repertorio de ácidos nucleicos que codifican un dominio VL, que incluye una CDR3 a

35 reemplazar o carece de una región que codifica CDR3. El ácido nucleico donador se puede seleccionar entre ácidos nucleicos que codifican una secuencia de aminoácidos sustancialmente como la expuesta en la SEQ ID NO: 17-40 o SEQ ID NO: 50-55.

[0056] Se puede introducir una secuencia que codifica una CDR de la invención (por ejemplo, CDR3) en un

40 repertorio de dominios variables que carecen de las respectivas CDR (por ejemplo, CDR3), usando tecnología de ADN recombinante, por ejemplo, usando la metodología descrita por Marks y col. (Bio/Technology (1992) 10: 779783). En particular, se pueden usar cebadores consenso dirigidos a o adyacentes al extremo 5' del área del dominio variable junto con cebadores consenso para la tercera región marco de los genes VH humanos para proporcionar un repertorio de dominios variables de VH que carecen de una CDR3. El repertorio se puede combinar con una CDR3 de un anticuerpo particular. Usando técnicas análogas, las secuencias derivadas de CDR3 se pueden combinar aleatoriamente con repertorios de dominios VH o VL que carecen de una CDR3, y los dominios VH o VL combinados aleatoriamente completos se pueden combinar con un dominio VH o VL cognado para preparar los anticuerpos específicos de PD-1 de la invención. A continuación el repertorio se puede presentar en un sistema hospedador adecuado tal como el sistema de presentación de fagos como se describe en el documento WO 92/01047 de manera que se puedan seleccionar fragmentos de unión al antígeno adecuados.

[0057] También han sido descritas técnicas combinatorias o de combinación aleatoria análogas por Stemmer (Nature (1994) 370: 389-391), quien describe la técnica en relación con un gen β-lactamasa, pero hace la observación de que esta aproximación se puede usar para la generación de anticuerpos.

[0058] En formas de realización adicionales, se pueden generar nuevas regiones VH o VL que portan una o más secuencias derivadas de las secuencias descritas en el presente documento usando mutagénesis aleatoria de uno o más genes VH y/o VL seleccionados. Una de esas técnicas, la PCR propensa a errores, ha sido descrita por Gram y col. (Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. (1992) 89: 3576-3580).

[0059] Otro procedimiento que se puede usar sirve para dirigir la mutagénesis a CDRs de genes VH o VL. Dichas técnicas han sido descritas por Barbas y col. (Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. (1994) 91: 3809-3813) y Schier y col. (J. Mol. Biol. (1996) 263: 551-567).

[0060] De manera similar, una o más, o las tres CDRs se pueden injertar en un repertorio de dominios VH o VL, que a continuación se someten a selección para un fragmento de unión al antígeno específico para PD-1.

[0061] Una fracción de un dominio variable de la inmunoglobulina comprenderá al menos una de las CDRs sustancialmente como se expone en el presente documento y, opcionalmente, regiones marco interpuestas procedentes de los fragmentos scFV como se expone en el presente documento. La porción puede incluir al menos el 50% aproximadamente de cualquiera o de ambas FR1 y FR4, siendo el 50% en el 50% C-terminal de FR1 y el 50% N-terminal de FR4. Restos adicionales en los extremos N-terminal o C-terminal de la parte sustancial del dominio variable pueden ser aquellos normalmente no asociados a las regiones del dominio variable de origen natural. Por ejemplo, la construcción de anticuerpos mediante técnicas de ADN recombinante puede dar como resultado la introducción de restos N- o C-terminales codificados por enlazadores introducidos para facilitar la clonación u otras etapas de manipulación. Estas otras etapas de manipulación incluyen la introducción de enlazadores para unir dominios variables a secuencias proteicas adicionales que incluyen las regiones constantes de la cadena pesada de inmunoglobulinas, otros dominios variables (por ejemplo, en la producción de diacuerpos), o marcadores proteináceos como se describe con mayor detalle a continuación.

[0062] Aunque las formas de realización ilustradas en los ejemplos comprenden un par de "acoplamiento" de los dominios VH y VL, la persona experta reconocerá que formas de realización alternativas pueden comprender fragmentos de unión a antígenos que contengan solamente una única CDR de cualquiera de los dominios VL o VH. Se puede usar uno cualquiera de los dominios de unión específicos de cadena sencilla para seleccionar dominios complementarios capaces de formar un fragmento de unión a antígenos específico de dos dominios capaz de, por ejemplo, unirse a PD-1. La selección se puede conseguir mediante procedimientos de selección con presentación de fagos usando la denominada aproximación jerárquica combinatoria dual descrita en el documento WO 92/01047, en la que una colonia individual que contiene un clon de cualquiera de las cadenas H o L se usa para infectar una librería completa de clones que codifican la otra cadena (L o H) y el dominio de unión específico de dos cadenas resultante se selecciona de acuerdo con las técnicas de presentación de fagos según se ha descrito.

[0063] Los anticuerpos contra PD1 descritos en el presente documento se pueden unir a otra molécula funcional, por ejemplo, otro péptido o proteína (albúmina, otro anticuerpo, etc.), toxina, radioisótopo, agentes citotóxicos o citostáticos. Por ejemplo, los anticuerpos se pueden unir por reticulamiento químico o procedimientos recombinantes. Los anticuerpos también se pueden unir a un polímero de una variedad de polímeros no proteináceos, por ejemplo, polietilenglicol, polipropilenglicol, o polioxialquilenos, de la forma expuesta en las patentes de EE.UU. Nº 4.640.835; 4.496.689; 4.301.144; 4.670.417; 4.791.192; o 4.179.337. Los anticuerpos se pueden modificar químicamente por conjugación covalente a un polímero, por ejemplo, para incrementar su semi-vida en circulación. Polímeros y procedimientos de ejemplos para unirlos también se muestran en las patentes de EE.UU. Nº 4.766.106; 4.179.337; 4.495.285; y 4.609.546.

[0064] Los anticuerpos descritos también se pueden alterar para que presenten un patrón de glicosilación que difiera del patrón nativo. Por ejemplo, se puede eliminar uno o más restos carbohidrato y/o se puede añadir uno o más sitios de glicosilación al anticuerpo original. La adición de los sitios de glicosilación a los anticuerpos descritos en el presente documento se puede conseguir alterando la secuencia de aminoácidos para que contengan secuencias consenso del sitio de glicosilación conocidas en la materia. Otros medios para incrementar el número de restos carbohidrato sobre los anticuerpos es mediante acoplamiento químico o enzimático de glicósidos a los restos de aminoácidos del anticuerpo. Dichos procedimientos se describen en el documento WO 87/05330 y en Aplin y col. (1981) CRC Crit. Rev. Biochem., 22: 259-306. La eliminación de cualquier resto carbohidrato de los anticuerpos se puede conseguir química o enzimáticamente, por ejemplo, como ha sido descrito por Hakimuddin y col. (1987) Arch. Biochem. Biophys., 259: 52; y Edge y col. (1981) Anal. Biochem., 118: 131 y por Thotakura y col. (1987) Meth. Enzymol., 138: 350. Los anticuerpos también se pueden marcar con un marcador detectable, o funcional. Los marcadores detectables incluyen radiomarcadores tales como 131I o 99Tc, que también se pueden unir a los anticuerpos usando la química convencional. Los marcadores detectables también incluyen marcadores enzimáticos tales como peroxidasa de rábano o fosfatasa alcalina. Los marcadores detectables además incluyen restos químicos tales como biotina, que se puede detectar mediante la unión a un resto cognado específico detectable, por ejemplo, avidina marcada.

[0065] Los anticuerpos en los que las secuencias de las CDR difieren sólo de manera irrelevante de las expuestas en las SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NOs: 16-40, SEQ ID NO: 47, o SEQ ID NO: 49 están englobados dentro del alcance de esta invención. Normalmente, un aminoácido es sustituido por un aminoácido relacionado que tenga una carga, una hidrofobicidad, o unas características estereoquímicas similares. Dichas sustituciones están dentro de las competencias de la persona con conocimientos ordinarios en la materia. A diferencia de las CDRs, en las FRs se pueden introducir cambios más sustanciales sin que afecten de manera adversa a las propiedades de unión de un anticuerpo. Los cambios en las FRs incluyen, pero no están limitados a, la humanización de residuos derivados no humanos o la manipulación genética de ciertos residuos marco que son importantes para el contacto con el antígeno

o para la estabilización del sitio de unión, por ejemplo, cambiando la clase o subclase de la región constante, cambiando restos de aminoácidos específicos que podrían alterar la función efectora como la unión del receptor Fc, por ejemplo, como se describe en las patentes de EE.UU. Nº 5.624.821 y 5.648.260 y Lund y col. (1991) J. Immun.

147: 2657-2662 y Morgan y col. (1995) Immunology 86: 319-324, o cambiando las especies de la que procede la región constante.

Ácidos nucleicos, clonación y sistemas de expresión

[0066] La presente descripción proporciona adicionalmente ácidos nucleicos aislados que codifican los anticuerpos descritos. Los ácidos nucleicos pueden comprender ADN o ARN y pueden ser completa o parcialmente sintéticos o recombinantes. La referencia a una secuencia de nucleótidos como se expone en el presente documento comprende una molécula de ADN con la secuencia especificada, y comprende una molécula de ARN con la secuencia especificada en la que el U es sustituido por T, a menos que el contexto requiera otra cosa.

[0067] Los ácidos nucleicos proporcionados en el presente documento comprenden una secuencia codificante para una CDR, un dominio VH, y/o un dominio VL descrito en el presente documento.

[0068] La presente descripción también proporciona construcciones en forma de plásmidos, vectores, fagémidos, casetes de trascripción o de expresión que comprenden al menos un ácido nucleico que codifica una CDR, un dominio VH, y/o un dominio VL descrito en el presente documento.

[0069] La descripción proporciona adicionalmente una célula hospedadora que comprende una o más construcciones como anteriormente.

[0070] Además se proporcionan ácidos nucleicos que codifican cualquier CDR (H1, H2, H3, L1, L2, o L3), un dominio VH o VL, así como procedimientos de preparación de los productos codificados. El procedimiento comprende la expresión del producto codificado a partir del ácido nucleico codificante. La expresión se puede conseguir mediante el cultivo de células hospedadoras recombinantes que contienen el ácido nucleico en condiciones adecuadas. Después de la producción mediante la expresión de un dominio VH o VL, o de un miembro de unión específico, se pueden aislar y/o purificar usando cualquier técnica adecuada, y a continuación se pueden utilizar según sea apropiado.

[0071] Los fragmentos de unión al antígeno, los dominios VH y/o VL, y las moléculas de ácidos nucleicos codificantes y vectores se pueden aislar y/o purificar de su entorno natural, en forma sustancialmente pura u homogénea, o en el caso de ácidos nucleicos, exentos o sustancialmente exentos de ácidos nucleicos o genes de origen distinto al de la secuencia que codifica un polipéptido con la función requerida.

[0072] Los sistemas para la clonación y expresión de un polipéptido en una variedad de células hospedadoras diferentes son muy conocidos en la materia. Para células adecuadas para la producción de anticuerpos, véase Gene Expression Systems, Academic Press, eds. Fernandez y col., 1999. En resumen, las células hospedadoras adecuadas incluyen bacterias, células vegetales, células de mamífero, y sistemas de levaduras y baculovirus. Las líneas celulares de mamíferos disponibles en la materia para la expresión de un polipéptido heterólogo incluyen células de ovario de hámster chino, células HeLa, células de riñón de cría de hámster, células de mieloma de ratón NS0, y muchas otras. Un hospedador bacteriano habitual es E. coli. Se puede usar cualquier sistema de expresión de proteínas compatible con la invención para producir los anticuerpos descritos. Los sistemas de expresión adecuados incluyen animales transgénicos descritos en Gene Expression Systems, Academic Press, eds. Fernandez y col., 1999.

[0073] Se pueden seleccionar o construir vectores adecuados, de manera que contengan secuencias reguladoras apropiadas, incluyendo secuencias promotoras, secuencias terminadoras, secuencias de poliadenilación, secuencias potenciadoras, genes marcadores y otras secuencias según sea necesario. Los vectores pueden ser plásmidos o víricos, por ejemplo, fagos, o fagémidos, según sea adecuado. Para detalles adicionales véase, por ejemplo, Sambrook y col., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. Muchas técnicas y protocolos conocidos para la manipulación de ácidos nucleicos, por ejemplo, en la preparación de construcciones de ácidos nucleicos, mutagénesis, secuenciación, introducción de ADN en células y expresión génica, y análisis de proteínas, se describen en detalle en Current Protocols in Molecular Biology, 2nd Edition, eds. Ausubel y col., John Wiley & Sons, 1992.

[0074] Un aspecto adicional de la descripción proporciona una célula hospedadora que comprende un ácido nucleico como se describe en el presente documento. Otro aspecto más proporciona un procedimiento que comprende la introducción de dicho ácido nucleico en una célula hospedadora. Para la introducción se puede emplear cualquier técnica disponible. Para células eucariotas, las técnicas adecuadas pueden incluir la transfección con fosfato de calcio, DEAE-dextrano, electroporación, transfección mediada por liposomas y transducción usando retrovirus u otros virus, por ejemplo, el virus de la vacuna o, para células de insecto, baculovirus. Para células bacterianas, las técnicas adecuadas pueden incluir la transformación con cloruro de calcio, la electroporación y la transfección usando bacteriófagos. La introducción del ácido nucleico en las células se puede seguir provocando o permitiendo la expresión del ácido nucleico, por ejemplo, cultivando células hospedadoras en condiciones para la expresión del gen.

Procedimientos de uso

[0075] Los anticuerpos contra PD-1 descritos son capaces de modular la regulación por defecto de las respuestas inmunitarias asociadas a PD-1. En formas de realización particulares, la respuesta inmunitaria está mediada por TcR/CD28. Los anticuerpos descritos pueden actuar como agonistas o antagonistas de PD-1, dependiendo de su procedimiento de uso. Los anticuerpos se pueden usar para prevenir, diagnosticar, o tratar trastornos médicos en mamíferos, especialmente en seres humanos. Los anticuerpos de la invención también se pueden usar para aislar PD-1 o células que expresan PD-1. Además, los anticuerpos se pueden usar para tratar a un sujeto en riesgo de contraer o susceptible a un trastorno o con un trastorno asociado a la expresión o función aberrante de PD-1.

[0076] Los anticuerpos de la invención se pueden usar en procedimientos para la inducción de tolerancia a un antígeno específico (por ejemplo, una proteína terapéutica). En una forma de realización, se induce tolerancia contra un antígeno específico mediante la administración simultánea del antígeno y un anticuerpo contra PD-1 de la invención. Por ejemplo, pacientes que han recibido el Factor VIII frecuentemente generan anticuerpos contra esta proteína; la administración simultánea de un anticuerpo contra PD-1 de la invención en combinación con Factor VIII recombinante se espera que dé como resultado la regulación por defecto de las respuestas inmunitarias a este factor de coagulación.

[0077] Los anticuerpos de la invención se pueden usar en circunstancias en las que pueda ser deseable una reducción en el nivel de respuesta inmunitaria, por ejemplo, en ciertos tipos de alergia o reacciones alérgicas (por ejemplo, mediante la inhibición de la producción de IgE), enfermedades autoinmunitarias (por ejemplo, artritis reumatoide, diabetes mellitus tipo I, esclerosis múltiple, enfermedad inflamatoria del intestino, enfermedad de Crohn, lupus eritematoso sistémico), rechazo al trasplante de tejidos, piel y órganos, y enfermedad de injerto contra hospedador (GVHD).

[0078] Cuando se desea una respuesta inmunitaria disminuida, los anticuerpos contra PD-1 de la invención se pueden usar como agonistas de PD-1 con el fin de potenciar la atenuación de la respuesta inmunitaria asociada a PD-1. En estas formas de realización, son necesarias la presentación simultánea y proximidad física entre señales positivas (es decir, mediadas por un receptor antigénico, por ejemplo, TcR o BcR) y negativas (es decir, PD-1). La distancia preferida es inferior o comparable al tamaño de una célula presentadora de antígenos de origen natural, es decir, inferior a 100 µm aproximadamente; más preferentemente inferior a 50 µm aproximadamente; y lo más preferentemente inferior a 20 µm aproximadamente.

[0079] En algunas formas de realización, las señales positivas (activadoras) y negativas (inhibidoras) son proporcionadas por un ligando o anticuerpos inmovilizados sobre una matriz de soporte sólido, o un portador. En diversas formas de realización, la matriz de soporte sólido puede estar compuesta de un polímero como agarosa activada, dextrano, celulosa, fluoruro de polivinilideno (PVDF). Alternativamente, la matriz de soporte sólido puede estar basada en sílice o polímeros de plástico, por ejemplo, nailon, dacrón, poliestireno, poliacrilatos, polivinilos, teflones, etc.

[0080] La matriz se puede implantar en el bazo del paciente. Alternativamente, la matriz se puede usar para la incubación ex vivo de células T obtenidas de un paciente, que a continuación se separan y se implantan de nuevo en el paciente. La matriz también puede estar compuesta de un material biodegradable tal como ácido poliglicólico, polihidroxialcanoato, colágeno, o gelatina de manera que se pueda inyectar en la cavidad peritoneal del paciente, y disolverse después de algún tiempo tras la inyección. El vehículo se puede moldear para mimetizar una célula (por ejemplo, una cuenta o microesfera).

[0081] En algunas formas de realización, la señal positiva se proporciona por medio de un anticuerpo contra CD3 que activa las células T, que se une a TcR. La activación de anticuerpos contra CD3 es muy conocida en la materia (véanse, por ejemplo, patentes de EE.UU. Nº 6.405.696 y 5.316.763). La relación entre la señal TcR de activación y la señal PD-1 negativa se determina experimentalmente usando procedimientos convencionales conocidos en la materia o como se describe en los Ejemplos 8, 9 y 10.

[0082] En ciertas circunstancias, puede ser deseable desencadenar o potenciar la respuesta inmunitaria de un paciente con el fin de tratar un trastorno inmunitario o cáncer. Los trastornos a tratar o prevenir con los procedimientos descritos incluyen, pero no están limitados a, infecciones por microbios (por ejemplo, bacterias), virus (por ejemplo, infecciones víricas sistémicas tales como gripe, enfermedades víricas cutáneas tales como herpes o culebrilla), o parásitos; y cáncer (por ejemplo, melanoma y cánceres de próstata).

[0083] La estimulación de la activación de las células T con anticuerpos contra PD-1 potencia las respuestas de las células T-T. En tales casos, los anticuerpos actúan como antagonistas de PD-1. Así, en algunas formas de realización, los anticuerpos se pueden usar para inhibir o reducir la actividad reguladora por defecto asociada a PD1, es decir, la actividad asociada a la regulación por defecto de la respuesta inmunitaria mediada por TcR/CD28. En estas formas de realización, los anticuerpos no están acoplados a una señal positiva como la estimulación mediada por TcR, por ejemplo, los anticuerpos se encuentran en su forma soluble no unida a un soporte. Como se demuestra en los Ejemplos, el bloqueo de la interacción PD-1/PDL con anticuerpos contra PD-1 antagonistas da lugar a respuestas proliferativas potenciadas de células T, consistentes con un papel regulador por defecto para la vía del PD-1 en interacciones T-T. En diversas formas de realización, los anticuerpos inhiben la unión de PD-L a PD-1 con una CI50 inferior a 10 nM y más preferentemente inferior a 5 nM, y lo más preferentemente inferior a 1 nM. La inhibición de la unión de PD-L se puede medir como se describe en el Ejemplo 6 o usado técnicas conocidas en la materia.

[0084] Los anticuerpos o composiciones de anticuerpos de la presente invención se administran en cantidades terapéuticamente eficaces. En general, una cantidad terapéuticamente eficaz puede variar con la edad, condición, y sexo del paciente, así como la gravedad de la dolencia médica del sujeto. Una cantidad terapéuticamente eficaz de un anticuerpo varía entre 0,001 aproximadamente y 30 mg/kg de peso corporal aproximadamente, preferentemente entre 0,01 aproximadamente y 25 mg/kg de peso corporal aproximadamente, entre 0,1 aproximadamente y 20 mg/kg de peso corporal aproximadamente, o entre 1 aproximadamente y 10 mg/kg de peso corporal aproximadamente. La dosificación se puede ajustar según sea necesario, para adaptarse a los efectos del tratamiento observados. La dosis apropiada la selecciona el facultativo que atiende basándose en indicaciones clínicas.

[0085] Los anticuerpos se pueden administrar como una dosis en bolo, para maximizar los niveles de anticuerpos en circulación durante el mayor tiempo posible después de la dosis. También se puede usar la infusión continua después de la dosis en bolo.

[0086] Las células inmunitarias (por ejemplo, células T, células B o monocitos activados) también se pueden aislar de un paciente y se pueden incubar ex vivo con anticuerpos de la invención. En algunas formas de realización, las respuestas inmunitarias se pueden inhibir retirando las células inmunitarias del sujeto, poniendo en contacto las células inmunitarias in vitro con un anticuerpo contra PD-1 de la invención simultáneamente con la activación de las células inmunitarias (por ejemplo, mediante anticuerpos para el receptor antigénico TcR y/o BcR). En dichas formas de realización, el anticuerpo contra PD-1 se debe usar de forma multivalente de manera que las moléculas de PD-1 sobre la superficie de una célula inmunitaria se "reticulen" tras la unión a dichos anticuerpos. Por ejemplo, los anticuerpos contra PD-1 pueden estar unidos a un soporte sólido, tal como cuentas, o se pueden reticular a través de un anticuerpo secundario. A continuación las células inmunitarias se pueden aislar usando procedimientos conocidos en la materia y se pueden reimplantar en el paciente.

[0087] En otro aspecto, los anticuerpos de la invención se pueden usar como agentes diana para la administración de otro agente terapéutico o de un agente citotóxico (por ejemplo, una toxina) en una célula que expresa PD-1. El procedimiento incluye la administración de un anticuerpo contra PD-1 acoplado a un agente terapéutico o citotóxico o en condiciones que permitan la unión del anticuerpo a PD-1.

[0088] Los anticuerpos de la invención también se pueden usar para detectar la presencia de PD-1 en muestras biológicas. La cantidad de PD-1 detectado se puede relacionar con el nivel de expresión de PD-1, que a su vez, está relacionado con el estado de activación de las células inmunitarias (por ejemplo, células T, células B, y monocitos activados) del sujeto.

[0089] Los procedimientos de detección que emplean anticuerpos son muy conocidos en la materia e incluyen, por ejemplo, ELISA, radioinmunoensayo, inmunotransferencia, transferencia de Western, inmunofluorescencia, inmunoprecipitación. Los anticuerpos se pueden suministrar en un kit diagnóstico que incorpore una o más de estas técnicas para detectar PD-1. Dicho kit puede contener otros componentes, envases, instrucciones, u otros materiales que ayuden en la detección de la proteína.

[0090] Cuando los anticuerpos están destinados a fines diagnósticos, puede ser deseable modificarlos, por ejemplo, con un grupo ligando (como biotina) o un grupo marcador detectable (como un grupo fluorescente, un radioisótopo o una enzima). Si se desea, los anticuerpos de la invención se pueden marcar usando técnicas convencionales. Los marcadores detectables adecuados incluyen, por ejemplo, fluoróforos, cromóforos, átomos radiactivos, reactivos con densidad electrónica, enzimas, y ligandos con pares de unión específicos. Las enzimas normalmente se detectan por su actividad. Por ejemplo, la peroxidasa de rábano se puede detectar por su capacidad para convertir la tetrametilbencidina (TMB) en un pigmento azul, cuantificable con un espectrofotómetro. Para su detección, los pares de unión adecuados incluyen, pero no están limitados a, biotina y avidina o estreptavidina, IgG y proteína A, y los numerosos pares receptor-ligando conocidos en la materia. Otras permutaciones y posibilidades serán muy evidentes para aquellos con conocimientos ordinarios en la materia, y se consideran equivalentes dentro del alcance de la presente invención.

[0091] Los anticuerpos de la invención se pueden usar en procedimientos de selección para identificar inhibidores de la vía del PD-1 eficaces como agentes terapéuticos. En dicho ensayo de selección, se forma una primera mezcla de unión combinando PD-1 y un anticuerpo de la invención; y se mide la cantidad de unión en la primera mezcla de unión (M0). También se forma una segunda mezcla de unión combinando PD-1, el anticuerpo, y el compuesto o agente a seleccionar, y se mide la cantidad de unión en la segunda mezcla de unión (M1). El compuesto a ensayo puede ser otro anticuerpo contra PD-1, como se ilustra en los Ejemplos. A continuación se comparan las cantidades de unión en la primera y segunda mezcla de unión, por ejemplo, calculando la relación de M1/M0. Se considera que el compuesto o agente es capaz de modular una regulación por defecto asociada a PD-1 de las respuestas inmunitarias si se observa una disminución en la unión en la segunda mezcla de unión comparada con la primera mezcla de unión. La formulación y optimización de las mezclas de unión están dentro de los niveles de competencia en la materia, dichas mezclas de unión también pueden contener tampones y sales necesarias para potenciar u optimizar la unión, y se pueden incluir ensayos de control adicionales en el ensayo de selección de la invención. Así se pueden identificar compuestos que reducen la unión de la anticuerpo PD-1 en al menos un 10% aproximadamente (es decir, M1/M0<0,9), preferentemente superior al 30% aproximadamente y a continuación, si se desea, en segundo lugar se pueden seleccionar por la capacidad de mejorar un trastorno en otros ensayos o modelos animales como se describe a continuación. La fuerza de unión entre PD-1 y el anticuerpo se puede medir usando, por ejemplo, un ensayo de inmunoadsorción unido a una enzima (ELISA), un radioinmunoensayo (RIA), tecnología basada en resonancia de un plasmón de superficie (por ejemplo, Biacore), todas ellas técnicas muy conocidas en la materia.

[0092] A continuación el compuesto se puede probar in vitro como se describe en los Ejemplos o en un modelo animal (véase, en general, Immunologic Defects in Laboratory Animals, eds. Gershwin y col., Plenum Press, 1981), por ejemplo, como el siguiente: el modelo de ratón transgénico SWR X NZB (SNF1) (Uner y col. (1998) J. Autoimmune. 11 (3): 233-240), el modelo de ratón transgénico KRN (K/BxN) (Ji y col. (1999) Immunol. Rev. 169: 139); los ratones NZB X NZW (B/W), un modelo para SLE (Riemekasten y col. (2001) Arthritis Rheum., 44(10): 24352445); encefalitis autoinmunitaria experimental (EAE) en ratón, un modelo para la esclerosis múltiple (Tuohy y col. (1988) J. Immunol. 141: 1126-1130, Sobel y col. (1984) J. Immunol. 132: 2393-2401, y Traugott, Cell Immunol. (1989) 119: 114-129); el modelo de diabetes en ratón NOD (Baxter y col. (1991) Autoimmunity, 9(1): 61-67), etc.).

[0093] Las dosis preliminares, por ejemplo, como se determina según las pruebas animales, y el aumento de escala de las dosificaciones para la administración a seres humanos se lleva a cabo según las prácticas aceptadas en la materia. La toxicidad y la eficacia terapéutica se pueden determinar mediante procedimientos farmacéuticos habituales en cultivos celulares o animales experimentales. Los datos obtenidos a partir de ensayos con cultivos celulares o estudios en animales se pueden usar en la formulación de un espectro de dosificaciones para uso en seres humanos. Las dosificaciones terapéuticamente eficaces conseguidas en un modelo animal se pueden convertir para su uso en otro animal, incluyendo seres humanos, usando factores de conversión conocidos en la materia (véase, por ejemplo, Freireich y col. (1966) Cancer Chemother. Reports, 50(4): 219-244).

Composiciones farmacéuticas y procedimientos de administración

[0094] La descripción proporciona composiciones que comprenden anticuerpos contra PD-1. Dichas composiciones pueden ser adecuadas para uso farmacéutico y administración a pacientes. Las composiciones normalmente comprenden uno o más anticuerpos de la presente invención y un excipiente farmacéuticamente aceptable. La frase "excipiente farmacéuticamente aceptable" incluye todos y cada uno de los disolventes, medios de dispersión, recubrimientos, agentes antibacterianos y agentes antifúngicos, agentes isotónicos, y agentes retardantes de la absorción, y similares, que sean compatibles con la administración farmacéutica. El uso de dichos medios y agentes para sustancias farmacéuticamente activas es muy conocido en la materia. Las composiciones también pueden contener otros compuestos activos que proporcionen funciones terapéuticas suplementarias, adicionales, o mejoradas. Las composiciones farmacéuticas también pueden estar incluidas en un contenedor, envase, o dispensador junto con instrucciones para su administración.

[0095] Una composición farmacéutica de la invención se formula para que sea compatible con su vía de administración prevista. Los procedimientos para conseguir esta administración son conocidos por aquellos con conocimientos ordinarios en la materia. La administración puede ser, por ejemplo, por vía intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, intracavitaria, subcutánea o transdérmica. También es posible obtener composiciones que se puedan administrar tópica u oralmente, o que se puedan transmitir a través de las membranas de la mucosa.

[0096] Las disoluciones o suspensiones usadas para la aplicación intradérmica o subcutánea normalmente incluyen uno o más de los siguientes componentes: un diluyente estéril tal como agua para inyección, disolución salina, aceites fijos, polietilenglicoles, glicerina, propilenglicol, u otros disolventes sintéticos; agentes antibacterianos tales como alcohol bencílico o metilparabenos; antioxidantes tales como ácido ascórbico o bisulfito sódico; agentes quelantes como ácido etilendiamintetracético; tampones como acetatos, citratos o fosfatos; y agentes para el ajuste de la tonicidad como cloruro sódico o dextrosa. El pH se puede ajustar con ácidos o bases, como ácido clorhídrico o hidróxido sódico. Dichas preparaciones se pueden introducir en ampollas, jeringas desechables o viales multidosis fabricados de vidrio o plástico.

[0097] Las composiciones farmacéuticas adecuadas para inyección incluyen disoluciones o dispersiones acuosas estériles y polvos estériles para la preparación extemporánea de disoluciones o dispersiones inyectables estériles. Para la administración por vía intravenosa, los vehículos adecuados incluyen disolución salina fisiológica, agua bacteriostática, Cremophor EL (BASF, Parsippany, NJ) o tampón fosfato salino (PBS). En todos los casos, la composición debe ser estéril y debería ser fluida hasta un grado en el que sea fácil su introducción en una jeringa. Debe ser estable en las condiciones de fabricación y almacenamiento y se debe preservar contra la acción contaminante de microorganismos como bacterias y hongos. La prevención de la acción de los microorganismos se puede conseguir mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal, y similares. En muchos casos será preferible incluir agentes isotónicos, por ejemplo, azúcares, polialcoholes como manitol, sorbitol, y cloruro sódico en la composición. El vehículo puede ser un disolvente o un medio de dispersión que contenga, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo, glicerol, propilenglicol, y polietilenglicol líquido, y similares), y sus mezclas adecuadas. La fluidez adecuada se puede mantener, por ejemplo, con el uso de un recubrimiento como lecitina, con el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de una dispersión y/o con el uso de tensioactivos. La absorción prolongada de composiciones inyectables se puede conseguir incluyendo en la composición un agente que retrase la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio, y gelatina.

[0098] Las composiciones orales en general incluyen un diluyente inerte o un vehículo comestible. Se pueden encerrar en cápsulas de gelatina o compactar en comprimidos. Para la administración por vía oral, los anticuerpos se pueden combinar con excipientes y se pueden usar en forma de comprimidos, trociscos, o cápsulas. Como parte de la composición se pueden incluir agentes de unión y/o materiales adyuvantes farmacéuticamente compatibles. Los comprimidos, píldoras, cápsulas, trociscos, y similares pueden contener cualquiera de los siguientes principios, o un compuesto de naturaleza similar; un aglutinante como celulosa microcristalina, goma de tragacanto o gelatina; un excipiente como fécula o lactosa, un agente desagregante como ácido algínico, Primogel, o fécula de maíz; un lubricante como estearato de magnesio o Sterotes; un glidante como dióxido de silicio coloidal; un agente edulcorante como sacarosa o sacarina; o un agente aromatizante como pipermín, salicilato de metilo, o esencia de naranja.

[0099] La administración sistémica también puede ser por medios transmucosas o transdérmicos. Para la administración transmucosa o transdérmica, en la formulación se usan penetrantes adecuados para la barrera a permear. Dichos penetrantes son conocidos de forma general en la materia, e incluyen, por ejemplo, detergentes, sales biliares, y derivados del ácido fusídico. La administración por vía transmucosa se puede conseguir, por ejemplo, con el uso de losanges, pulverizadores nasales, e inhaladores, o supositorios. Por ejemplo, en el caso de anticuerpos que comprenden la fracción Fc, las composiciones pueden ser capaces de atravesar las membranas mucosas del intestino, boca, o pulmones (por ejemplo, a través de la vía mediada por el receptor FcRn como se describe en la patente de EE.UU. Nº 6.030.613). Para la administración por vía transdérmica, los compuestos activos se pueden formular en ungüentos, bálsamos, geles, o cremas como es sabido de forma general en la materia. Para la administración por inhalación, los anticuerpos se pueden suministrar en forma de pulverizador en aerosol procedente de un contenedor o dispensador presurizado, que contiene un propelente adecuado, por ejemplo, un gas como dióxido de carbono, o un nebulizador.

[0100] En ciertas formas de realización, los anticuerpos descritos en el presente documento se preparan con vehículos que protegerán al compuesto de la eliminación rápida del cuerpo, tal como una formulación de liberación controlada, incluyendo implantes y sistemas de administración microencapsulados. Se pueden usar polímeros biodegradables y biocompatibles, como acetato de etilenvinilo, polianhídridos, ácido poliglicólico, colágeno, poliortoésteres, y ácido poliláctico. Los procedimientos para la preparación de dichas formulaciones serán evidentes para los expertos en la materia. También se pueden usar como vehículos farmacéuticamente aceptablessuspensiones liposomales que contengan los anticuerpos descritos en el presente documento. Éstas se pueden preparar según los procedimientos conocidos por los expertos en la materia, por ejemplo, como se describe en la patente de EE.UU. Nº 4.522.811.

[0101] Para comodidad en la administración y uniformidad de la dosificación puede ser ventajoso formular las composiciones orales o parenterales en formas de dosificación unitarias. La expresión "forma de dosificación unitaria" como se usa en el presente documento se refiere a unidades físicamente discretas adaptadas como dosificaciones unitarias para el sujeto a tratar; cada unidad que contiene una cantidad predeterminada de compuesto activo calculada para producir el efecto terapéutico deseado junto con el vehículo farmacéuticamente adecuado.

[0102] La toxicidad y eficacia terapéutica de la composición de la invención se pueden determinar mediante procedimientos farmacéuticos habituales en cultivos celulares o animales experimentales, por ejemplo, para determinar la DL50 (dosis letal para el 50% de la población) y la DE50 (dosis terapéuticamente eficaz en el 50% de la población). La relación de las dosis entre los efectos tóxicos y terapéuticos es el índice terapéutico y se puede expresar como la relación DL50/DE50. Se prefieren composiciones que presentan índices terapéuticos grandes.

[0103] Para cualquier composición usada en la presente invención, la dosis terapéuticamente eficaz se puede estimar inicialmente a partir de ensayos de cultivos celulares. Ejemplos de bioensayos adecuados incluyen ensayos de replicación del ADN, ensayos de liberación de citoquinas, ensayos basados en la transcripción, ensayos de unión PD-1/PD-L1, ensayos de la creatina quinasa, ensayos basados en la diferenciación de los pre-adipocitos, ensayos basados en la captación de glucosa en los adipocitos, ensayos inmunológicos distintos de, por ejemplo, los ensayos descritos en los Ejemplos. Los datos obtenidos de los ensayos de cultivos celulares y estudios animales se pueden usar en la formulación de un espectro de dosificaciones para su uso en seres humanos. Se puede formular una dosis en modelos animales para conseguir un intervalo de concentraciones en plasma circulante que incluya la CI50 (es decir, la concentración del anticuerpo que consigue una inhibición semi-máxima de los síntomas). Los niveles circulantes en plasma se pueden medir, por ejemplo, mediante cromatografía de líquidos de alto rendimiento. Los efectos de cualquier dosificación particular se pueden controlar con un bioensayo adecuado. La dosificación preferentemente está dentro de un intervalo de concentraciones circulantes con poca o ninguna toxicidad. La dosificación puede variar dependiendo de la forma de dosificación empleada y la vía de administración utilizada.

EJEMPLOS

Ejemplo 1: Selección de ScFv de unión a PD-1

[0104] Se usó una librería de fagémidos scFv, que es una versión expandida de la librería 1,38 x 1010 descrita por Vaughan y col. (Nature Biotech. (1996) 14: 309-314) para seleccionar anticuerpos específicos para el PD-1 humano. La proteína de fusión soluble PD-1 (a 20 µg/ml en tampón fosfato salino (PBS)) o la proteína de fusión control (a 50 µg/ml en PBS) se recubrió en pocillos de una placa de microtitulación durante toda la noche a 4°C. Los pocillos se lavaron en PBS y se bloquearon durante 1 hora a 37°C en MPBS (leche en polvo al 3% en PBS). El fago purificado (1012 unidades de transducción (tu)) se bloqueó durante 1 hora en un volumen final de 100 µl de MPBS al 3%. El fago bloqueado se añadió a los pocillos de la proteína de fusión control y se incubó durante 1 hora. Los fagos bloqueados y deseleccionados a continuación se transfirieron a los pocillos bloqueados recubiertos con la proteína de fusión PD-1 y se incubaron durante una hora más. Los pocillos se lavaron 5 veces con PBST (PBS que contienen Tween 20 al 0,1% v/v), y a continuación 5 veces con PBS. Las partículas de fago unidas se eluyeron y se usaron para infectar 10 ml de E. coli TG1 en fase de crecimiento exponencial. Las células infectadas se crecieron en caldo 2TY durante 1 hora a 37°C, a continuación se extendieron sobre placas 2TYAG y se incubaron durante toda la noche a 30°C. Las colonias se transfirieron de las placas con un rascador en 10 ml de caldo 2TY y se añadió glicerol al 15% para el almacenamiento a - 70°C.

[0105] Los cultivos de la disolución madre de glicerol procedentes de la primera ronda de selección por inmunoadsorción se sobreinfectaron con un fago ayudante y se rescataron para dar partículas de fago que expresan el anticuerpo scFv para la segunda ronda de inmunoadsorción. De esta forma se llevaron a cabo un total de dos rondas de inmunoadsorción para el aislamiento de PD1-17, excepto que para la deselección en la segunda ronda de inmunoadsorción se usaron 20 µg/ml de proteína control. Después de las tres rondas de selección se seleccionaron los clones PD1-28, PD1-33, y PD1-35. La deselección en la segunda y tercera ronda se llevó a cabo usando 10 µg/ml de proteína de fusión control.

[0106] Se seleccionaron anticuerpos para PD-1 murino por selección soluble usando la proteína de fusión PD1 murina biotinilada a una concentración final de 100 nM. Se usó una librería de fagémidos scFv, como se ha descrito anteriormente. Los fagos scFv purificados (1012 tu) en 1 ml de MPBS al 3% se bloquearon durante 30 minutos, a continuación se añadió antígeno biotinilado y se incubó a temperatura ambiente durante 1 hora. Se añadió fago/antígeno a 250 µl de cuentas magnéticas de estreptavidina Dynal M280 Streptavidin que habían sido bloqueadas durante 1 hora a 37°C en 1 ml de MPBS al 3% y se incubó durante 15 minutos más a temperatura ambiente. Las cuentas se capturaron usando una rejilla magnética y se lavaron 4 veces en 1 ml de MPBS al 3%/Tween 20 al 0,1% (v/v) seguido de 3 lavados en PBS. Después del último lavado en PBS, las cuentas se resuspendieron en 100 µl de PBS y se usaron para infectar 5 ml de células E. coli TG-1 en fase de crecimiento exponencial. Las células infectadas se incubaron durante 1 hora a 37°C (30 minutos en reposo, 30 minutos con agitación a 250 rpm), y a continuación se extendieron sobre placas 2TYAG y se incubaron durante toda la noche a 30°C. Las colonias resultantes se extrajeron de las placas con un rascador y los fagos se rescataron como se ha descrito anteriormente. Se llevó a cabo una segunda ronda de selección soluble como se ha descrito anteriormente.

Ejemplo 2: Especificidad de los anticuerpos para PD-1 mediante un ELISA de fagos

[0107] Para determinar la especificidad de los anticuerpos por PD-1, se llevó a cabo un ELISA de fagos contra la proteína de fusión PD-1 y proteínas control. Colonias individuales de E. coli procedentes de los resultados de la selección se pusieron en placas de 96 pocillos que contienen 100 µl de medio 2TYAG por pocillo. Se añadió el fago ayudante M13K07 para una multiplicidad de infección (moi) de 10 para el cultivo que crece en fase exponencial y las placas se incubaron durante 1 hora más a 37°C. Las placas se centrifugaron en una centrífuga de sobremesa a 2000 rpm durante 10 minutos. Se retiró el sobrenadante y los sedimentos celulares se resuspendieron en 100 µl de 2TYAK y se incubaron a 30°C durante toda la noche con agitación. Al día siguiente, las placas se centrifugaron a 2000 rpm durante 10 minutos y el sobrenadante que contiene los fagos procedentes de cada pocillo se transfirió a una placa nueva de 96 pocillos. Las muestras con los fagos se bloquearon a una concentración final de MPBS al 3% antes del ELISA.

[0108] La proteína de fusión PD-1 humana y de ratón y proteínas de fusión y no fusión control se recubrieron durante toda la noche a 4°C en placas de microtitulación de 96 pocillos a 0,5-2,5 µg/ml en PBS. Después del recubrimiento, las disoluciones se extrajeron de los pocillos, y las placas se bloquearon durante 1 hora en MPBS al 3%. Las placas se enjuagaron con PBS y a continuación se añadieron 50 µl de fago pre-bloqueado a cada pocillo. Las placas se incubaron durante 1 hora y a continuación se lavaron 3 veces con PBST seguido de 3 lavados con PBS. Se añadieron 50 µl de una dilución 1:5000 de conjugado anti-M13-HRP (Pharmacia, Peapack, NJ) a cada pocillo, y las placas se incubaron durante 40-60 minutos. Cada placa se lavó tres veces con PBST, y a continuación 3 veces con PBS. Se añadieron 50 µl de sustrato TMB a cada pocillo, y las muestras se incubaron hasta que apareció color. La reacción se detuvo con la adición de 25 µl de H2SO4 0,5 M. La señal generada se midió leyendo la absorbancia a 450 nm usando un lector de placas de microtitulación. Así se identificaron y se confirmaron los clones que presentan una unión específica a la proteína de fusión PD-1, pero no a las proteínas de fusión control.

[0109] Los datos de especificidad para scFv PD1-17 se muestran en la Figura 1A. La reactividad de scFv PD1-28, PD1-33, y PD1-35 con el PD-1 humano se muestra en la Figura 1B (un control IgG1 no se unió a PD-1).

Ejemplo 3: Identificación de clones de anticuerpos

[0110] Clones de E. coli scFv que se unen a PD-1 se sembraron en placas 2TYAG y se incubaron durante toda la noche a 30°C. Las colonias procedentes de estas placas se secuenciaron usando la secuencia de oligonucleótidos del vector pCANTAB6 para amplificar las regiones VH y VL del clon scFv. Se sometieron a ensayo clones de unión a PD-1 únicos para la neutralización de la unión de PD-L1 a PD-1 como se ha descrito en el Ejemplo 4. Las diferencias en la secuencia entre los formatos scFv e IgG son debidas a cambios introducidos por los

5 cebadores de la PCR durante la conversión de scFv a IgG.

Ejemplo 4: Ensayo de inhibición de unión bioquímica y selección

[0111] Se indujo la producción de ScFv mediante la adición de IPTG 1 mM a cultivos en fase de crecimiento

10 exponencial e incubación durante toda la noche a 30°C. Se obtuvieron extractos periplasmáticos que contienen scFv en bruto sometiendo a los sedimentos bacterianos procedentes de la inducción durante toda la noche a choque osmótico. Los sedimentos se resuspendieron en sacarosa al 20% (p/v), Tris-HCl 50 mM, pH 7,5, EDTA 1 mM y se enfriaron el hielo durante 30 minutos. Los restos celulares se eliminaron por centrifugación, y la scFv se purificó por cromatografía e intercambio iónico con tampón en PBS. Las scFv purificadas (PD1-17, PD1-28, PD1-33, y PD1-35)

15 se sometieron a ensayo para la capacidad de inhibir la unión de la proteína de fusión PD-L1 humana biotinilada a la proteína de fusión PD-1 humana inmovilizada en un ensayo en placa de microtitulación de 96 pocillos. La unión de la proteína de fusión PD-L1 biotinilada se detectó con AMDEX-fosfatasa alcalina, y la señal generada se midió leyendo la absorbancia a 405 nm usando un lector de placas de microtitulación. Los datos se expresan como porcentaje de la unión total y se sometió a ensayo una titulación de concentraciones de scFv para establecer la potencia de los

20 clones calculada en valores de CI50. Los datos de la potencia de los clones para los anticuerpos scFv e Ig se muestran en la Tabla 5.

[0112] Se produjo y se purificó scFv PD1-F2 como se ha descrito anteriormente. Se añadieron células que expresan PD-1 murino a 105 células/pocillo en un volumen final de 100 µl a una placa de microtitulación de 96 25 pocillos recubierta con poli-D-lisina. Las células se centrifugaron y se lavaron dos veces en PBS, y a continuación se bloquearon con 300 µl de BSA al 1% en PBS durante 1 hora a temperatura ambiente. Las células bloqueadas se lavaron tres veces en PBST, antes de la adición de 25 µl/pocillo de tampón de ensayo (BSA al 0,05%, Tween 20 al 0,05% en PBS de Dulbecco) o de la muestra, seguido de 25 µl de proteína de fusión PD-L1 murina biotinilada a 300 ng/ml. La unión de la proteína de fusión PD-L1 biotinilada se detectó con Amdex-fosfatasa alcalina y las señales se

30 leyeron como se ha descrito anteriormente. La potencia de las scFv PD1-F2 e IgG se muestran en la Tabla 6.

Tabla 6: Potencia de anticuerpos scFv e IgG contra PD-1

Clon: CI50 de ScFv (nM) CI50 de IgG (nM)

PD1-17: 726 2,5

PD1-28: 560 1,4

PD1-33: 74 1,8

PD1-35: 85 2,3

PD1-F2: 28 1,0

Ejemplo 5: Conversión de ScFv en IgG

35 [0113] Se amplificaron por PCR las regiones V de la cadena pesada y ligera de clones scFv usando cebadores específicos para los clones. Los productos de la PCR se digirieron con las enzimas de restricción apropiadas y se subclonaron en vectores que contienen el dominio constante de la cadena pesada de la IgG1 humana (Takahashi y col. (1982) Cell 29, 671) o vectores que contienen los dominios constantes de la cadena ligera

40 lambda o kappa humana (Hieter y col. (1982) Nature 294, 536). Basándose en las líneas germinales de los segmentos VH y VL, se determinó si para la conversión se habían usado los dominios constantes de la cadena ligera kappa o lambda (Tabla 7).

Tabla 7: Líneas germinales de las regiones VH y VL de los clones de anticuerpos PD-1

Clon: Línea germinal de VH Línea germinal de VL

PD1-17: DP-70 DPL-8

PD1-28: DP-14 DPL-23

PD1-33: DP-7 DPL-11

PD1-35: DP-65 DPL-2

PD1-F2: DP-47 L12 (k)

[0114] La inserción de los dominios de la región V en plásmidos se verificó con la secuenciación del ADN plasmídico procedente de colonias individuales de E. coli. Los plásmidos se prepararon a partir de cultivos de E. coli mediante técnicas habituales y las construcciones de la cadena pesada y ligera se transfirieron simultáneamente a células eucariotas usando técnicas habituales. La IgG segregada se purificó usando Protein A Sepharose (Pharmacia) e intercambio de tampón en PBS.

[0115] La afinidad de unión del anticuerpo contra PD1 de ratón y PD1-F2 se determinó usando un sistema de resonancia de un plasmón de superficie (SPR) (BIAcore 3000) (Biacore, Piscataway, NJ) con una proteína de fusión PD-1 murina inmovilizada sobre un chip sensor CM5. La concentración de PD1-F2 en la celda de flujo varía entre 7,81 y 125 nM, mientras que la concentración del anticuerpo J43 contra PD1 de ratón (eBioscience, San Diego, CA) varía entre 25 nM y 500 nM. La constante de equilibrio KD para PD1-F2 es 6,7 x 10-9 M (KA = 1,5 x 108 M-1), mientras que la KD para J43 es 3,8 x 10-7 M (KA = 2,6 x 106 M-1).

[0116] La capacidad de la IgG contra PD-1 para unirse a PD-1 humano o murino se determinó de la manera siguiente. Se incubaron placas de ELISA con 2,5 µg/ml de quimera PD-1/IgG humana durante toda la noche. Las placas se lavaron con PBS/BSA al 1% y se incubaron con diluciones seriadas de un anticuerpo de prueba durante 2 horas a temperatura ambiente (RT). Después del lavado, se añadieron concentraciones saturantes de anticuerpo de cabra contra humano conjugado a HRP o anticuerpo de conejo contra ratón conjugado a HRP, y las muestras se incubaron durante 1 hora a RT. Los anticuerpos de cabra y conejo no unidos se lavaron usando PBS/BSA al 1%. El ensayo se reveló usando TBM. Los resultados se expresaron como valores de absorbancia a una DO de 405 nm y se presentan en las Figuras 2A-2C. El anticuerpo murino J110 contra PD-1 humano está disponible comercialmente (eBioscience, San Diego, CA) y se incluyó con fines comparativos.

Ejemplo 6: Anticuerpos PD-1 seleccionados inhiben la unión de PD-L1 a PD-1

[0117] Se llevaron a cabo ensayos de inhibición para valorar la capacidad de los anticuerpos para bloquear la unión de PD-L1 a PD-1. Se llevó a cabo un ELISA como se ha descrito en el Ejemplo 2 con modificaciones. Después de la incubación con un anticuerpo primario contra PD-1 durante 2 horas a RT, se añadió una concentración fija (1 µg/ml) de PD-L1-Ig conjugado con biotina, y las muestras se incubaron adicionalmente durante 1 hora a RT. Después de lavar, se añadieron concentraciones saturantes de avidina-HRP, y se incubó durante 1 hora a RT. La avidina-HRP sin unir se lavó usando PBS/BSA al 1%. El ensayo se reveló usando TMB.

[0118] Los resultados se compararon con los obtenidos con J110 como se muestra en la Figura 3. Los anticuerpos J110 y PD1-30 contra PD-1 humano no inhibieron la unión de PD-L1 a PD-1. Los anticuerpos PD1-17, PD1-28, PD1-33, y PD1-35 contra seres humanos y el anticuerpo PD1-F2 contra ratón bloquean la interacción PD1/PD-L1.

Ejemplo 7: Los anticuerpos PD-1 reconocen sitios distintos sobre PD-1

[0119] Se llevaron a cabo ensayos de inhibición para mapear sitios reconocidos por los diversos anticuerpos contra PD-1 humano. Se llevó a cabo un ELISA como se ha descrito en el Ejemplo 6 con pequeñas modificaciones. Después de la incubación con anticuerpo primario durante 2 horas a RT, se añadió una concentración fija (0,25 µg/ml) de anticuerpo J110 contra PD-1 conjugado con biotina, y las muestras se incubaron adicionalmente durante 1 hora a RT. Después de lavar, se añadieron concentraciones saturantes de avidina-HRP, y se incubó durante 1 hora a RT. La avidina-HRP no unida se lavó usando PBS/BSA al 1%. El ensayo se reveló usando TMB.

[0120] Como se muestra en la Figura 4, la unión de anticuerpos contra PD-1 humano (J110, J116, PD1-17, PD1-28, PD1-33, y PD1-35) define al menos dos sitios diferentes sobre PD-1. Los resultados del bloqueo cruzado muestran que J110 y J116 se unen a sitios idénticos o que se solapan mientras que PD1-17, 28, 33, y 35 se unen a otro sitio diferente. La unión de J116 o J110 a PD-1 bloquea la unión de J110. En contraste, la unión de PD1-17, PD1-28, PD1-33, y PD1-35 no bloquea la unión de J110. Esto sugiere que los anticuerpos contra PD-1 probados se unen a, al menos, dos epítopos diferentes: uno reconocido por J110 y J116, y el otro reconocido por PD1-17, PD128, PD1-33, y PD1-35.

Ejemplo 8: El acoplamiento de PD-1 da como resultado una reducción en las respuestas de las células T

[0121] Se estimularon células T CD4+ (5 x 104 células/pocillo) con cuentas de tosilo (Dynal, Great Neck, NY) recubiertas con anticuerpo anti-hCD3 +/- PD-L1-Fc o anti-PD-1 (PD1-17 o J110). La concentración de las proteínas de fusión o los títulos de anticuerpo fueron como se indica en el eje de abscisas en la Figura 5. Después de 72 horas, se determinó la proliferación mediante la incorporación de 3H-timidina. La radiactividad incorporada se determinó usando un lector de placas LKB 1205.

[0122] Como se muestra en la Figura 5, el acoplamiento de PD-1 por el anticuerpo contra PD-1, PD1-17 o PD-L1.Fc provocó una reducción en la proliferación de células T. Así, PD1-17 puede mimetizar ligandos de PD-1 y proporcionar una señal inhibitoria. Como se describe a continuación (Ejemplo 9), esta señal inhibitoria da como resultado una reducción en la proliferación de células T y en la producción de IL-2. Los anticuerpos PD1-28, PD1-33, y PD1-35 tienen el mismo efecto que PD1-17. El efecto depende de la dosis, puesto que la activación de las células en presencia de concentraciones crecientes de PD1-17 o PD-L1.Fc da como resultado una reducción en la proliferación de células T. Los anticuerpos control contra PD-1, J110 (Figura 5) o J116 (datos no mostrados), no inhiben las respuestas de las células T y el incremento de la concentración de J110 tiene un efecto mínimo sobre la proliferación de células T. Para fines comparativos, los valores están representados como porcentaje de la respuesta contra CD3. "100%" representa las CPMs obtenidas cuando las células se activan con microesferas recubiertas de IgG murina contra CD3. En conjunto estos resultados indican que algunos, pero no todos los anticuerpos, que reconocen PD-1, pueden actuar como agonistas de la vía del PD-1.

[0123] Se llevaron a cabo experimentos adicionales para abordar si la regulación por defecto de PD-1 de las respuestas de las células T requería un acoplamiento coordinado de TcR/PD-1 sobre una superficie celular única (CIS) o separada (TRANS). Se prepararon dos grupos de microesferas: un grupo contenía anti-CD3 y PD-L1.Fc (CIS), y el otro contenía anti-CD3 o PD-L1.Fc (TRANS). La inhibición a través de PD-1 sólo se observó en condiciones en las que tanto PD-1 como TcR se acoplaron con ligandos sobre la misma superficie (CIS). A todas las relaciones de cuentas:célula probadas, no se observó inhibición en condiciones en las que las señales de TCR y PD-1 se proporcionan sobre superficies separadas (TRANS).

[0124] Para descartar impedimentos estéricos en los experimentos TRANS, se prepararon ensayos similares usando anticuerpo contra CD3 y B7.2.Fc. En estos ensayos, se observó la estimulación simultánea con B7 de respuestas de células T tanto en condiciones CIS como TRANS. En conjunto, estos hallazgos demuestran que la proximidad de PD-1 a TCR es necesaria para la función moduladora del receptor sobre la activación de las células T. Por tanto, para modular una respuesta de las células T, ambas señales activantes e inhibidoras debe proceder de la misma superficie ya sea ésta la superficie de una célula o de una cuenta.

Ejemplo 9: El bloqueo del acoplamiento de PD-1 por los anticuerpos da como resultado una proliferación aumentada

[0125] Para valorar el efecto del anticuerpo contra PD-1 soluble sobre la proliferación, se pre-activaron células T CD4+ durante 48 horas con cuentas recubiertas de anticuerpo anti-CD3/anti-CD28, se recogieron, y se volvieron a estimular con la concentración indicada de PHA más 10 ng/ml de IL-2 en presencia de PD1-17, J110, o IgG control. Se añadió cada uno de los anticuerpos a diferentes concentraciones al inicio del cultivo. La proliferación se midió a las 72 horas.

[0126] Los resultados demuestran que PD1-17 (Figura 6) y PD1-35 (datos no mostrados) potenciaron la proliferación de células T primarias. El anticuerpo control J110 no potenció las respuestas de las células T in vitro. Anticuerpos contra PD1 seleccionados, como los ejemplificados por PD1-17 y PD-35, inhiben la interacción de PD-1 con sus ligandos naturales y de esta forma bloquean la transmisión de una señal negativa. El bloqueo de la señal negativa también da como resultado una proliferación y una producción de IL-2 mejoradas.

Ejemplo 10: Tratamiento de trastornos

[0127] La modulación de la respuesta inmunitaria modulada por PD-1 es útil en casos en los que se desea un efecto inmunosupresor o un aumento de la respuesta inmunitaria. Este ejemplo describe el uso de anticuerpos PD-1 como agonistas o antagonistas de PD-1 para tratar a un sujeto al comienzo de la enfermedad o que tiene un trastorno inmunitario o un cáncer establecido, respectivamente.

[0128] Los sujetos con riesgo de padecer o afectados con un cáncer que pueden necesitar un aumento de la respuesta inmunitaria se beneficiarían del tratamiento con un antagonista de PD-1, tal como un anticuerpo contra PD-1 de la presente invención en una forma soluble. Más habitualmente, los anticuerpos se administran a pacientes ambulatorios mediante administración semanal a una dosis de 0,1-10 mg/kg aproximadamente por infusión intravenosa (IV) lenta. La dosis terapéuticamente eficaz apropiada de un antagonista es seleccionada por el facultativo que atiende y estará aproximadamente en el intervalo de 1 µg/kg a 20 mg/kg, de 1 µg/kg a 10 mg/kg, de 1 µg/kg a 1 mg/kg, de 10 µg/kg a 1 mg/kg, de 10 µg/kg a 100 µg/kg, de 100 µg a 1 mg/kg, y de 500 µg/kg a 5 mg/kg.

[0129] Los anticuerpos también se usaron para prevenir y/o reducir la gravedad y/o los síntomas de dolencias

o enfermedades que implican una respuesta inmunitaria aberrante o no deseable, tales como en los trastornos autoinmunitarios ejemplificados a continuación.

[0130] La esclerosis múltiple (MS) es una enfermedad del sistema nervioso central que se caracteriza por la inflamación y pérdida de las vainas de mielina. En el modelo de ratón de encefalitis autoinmunitaria experimental (EAE) para la esclerosis múltiple (Tuohy y col. (J. Immunol. (1988) 141: 1126-1130), Sobel y col. (J. Immunol. (1984)

132: 2393-2401), y Traugott (Cell Immunol. (1989) 119: 114-129), se espera que el tratamiento de ratones con un agonista de PD-1 antes de (y de manera continua a) la EAE prevenga o retrase el comienzo de la MS.

[0131] La artritis es una enfermedad caracterizada por la inflamación de las articulaciones. En el modelo de ratón de artritis inducida por colágeno (CIA) para artritis reumatoide (Courtenay y col. (Nature (1980) 283: 666-628) y 5 Williams y col. (Immunol. (1995) 84: 433-439)), se espera que el tratamiento con un agonista de PD-1 evite o trate la artritis reumatoide (RA) u otros trastornos artríticos.

[0132] El lupus eritematoso sistémico (SLE) es una enfermedad autoinmunitaria caracterizada por la presencia de autoanticuerpos. Los anticuerpos y composiciones de esta invención se pueden usar como agonistas

10 de PD-1 para inhibir las actividades de células T y células B autorreactivas, y prevenir o tratar el SLE o enfermedades relacionadas en ratones NZB X NZW (un modelo de ratón para el SLE) (Immunologic Defects in Laboratory Animals, Gershwin y col. eds., Plenum Press, 1981) o en seres humanos.

[0133] Se ha anticipado que los anticuerpos PD-1 de la invención se administrarán como agonistas de PD-1

15 en terapia ex vivo con una frecuencia de uno al mes o inferior. La duración del tratamiento puede abarcar entre un mes y varios años.

[0134] Para probar la eficacia clínica de anticuerpos en seres humanos, se identifican individuos con melanoma, cáncer de próstata, RA, SLE, MS, diabetes tipo I, y se seleccionan de manera aleatoria para un grupo de

20 tratamiento. Los grupos de tratamiento incluyen un grupo placebo y de uno a tres grupos tratados con un agonista de PD-1 (dosis diferentes). Los individuos se someten a seguimiento prospectivamente de uno a tres años. Se ha anticipado que los individuos que reciben el tratamiento presentarán una mejoría.

LISTADO DE SECUENCIAS 25 [0135]

<110> Collins, Mary y col.

<120> ANTICUERPOS CONTRA PD-1 Y SUS USOS

<130> 08702.6098-00000

<160> 58 30 <170> PatentIn version 3.1

<210> 1

<211> 384

<212> ADN

<213> Homo sapiens 35 <400> 1

imagen1

<210> 2

<211> 128

<212>: PRT 40 <213> Homo sapiens

<400> 2

<210> 3

<211> 330

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 3

<210> 4

<211> 110

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 4

<210> 5

<211> 357

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

imagen1

<400> 5

imagen1

<210> 6

<211> 119 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 6

imagen1

<210> 7

<211> 324

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 7

<210> 8

<211> 108

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

imagen1

<400> 8

imagen1

<210> 9 10 <211> 357

<212> ADN

<213> Homo sapiens

<400> 9

imagen1

5 <210> 10

<211> 119

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 10

imagen2

imagen1

<210> 11

<211> 333

<212> ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 11

imagen1

<210> 12

<211> 111

<212> PRT

<213> Homo sapiens 5 <400> 12

imagen1

<210> 13

<211> 381

<212>: ADN 10 <213> Homo sapiens

<400> 13

<210> 14

<211> 127

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 14

<210> 15

<211> 336

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

imagen1

<400> 15

imagen1

<210> 16

<211> 112 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 16

imagen1

<210> 17

<211> 12

<212> PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 17

imagen1

<210> 18

<211> 16 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 18

imagen1

<210> 19 15 <211> 13

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 19

imagen1

<210> 20

<211> 13

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 20

imagen1

<210> 21

<211> 7

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 21

<210> 22

<211> 9

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 22

imagen1

<210> 23

<211> 5

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 23

<210> 24

<211> 17

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 24

imagen1

<210> 25

<211> 10

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 25 <210> 26

imagen1

<211> 11

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 26

<210> 27

<211> 7

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 27

imagen1

<210> 28

<211> 11

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 28

<210> 29

<211> 5

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 29

imagen1

<210> 30

<211> 17

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 30

imagen1

<210> 31

<211> 10

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 31

imagen1

<210> 32

<211> 14

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 32 <210> 33

imagen1

<211> 7

<212> PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 33

<210> 34

<211> 12 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 34

imagen1

<210> 35 15 <211> 7

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 35

20 <210> 36

<211> 16

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 36

imagen1

imagen3

<210> 37

<211> 17

<212> PRT

<213> Homo sapiens 30 <400> 37

imagen1

<210> 38

<211> 13

<212> PRT 35 <213> Homo sapiens

<400> 38

imagen1

<210> 39

<211> 7

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 39

5 <210> 40

<211> 11

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 40

imagen1

10

<210> 41

<211> 288

<212> PRT

<213> Homo sapiens 15 <400> 41

imagen1

<210> 42

<211> 320

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 42

<210> 43

<211> 106

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 43

<210> 44

<211> 960

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 44

<210> 45

<211> 330

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 45

<210> 46

<211> 366

<212>: ADN 5 <213> Homo sapiens

imagen1

<400> 46

imagen1

<210> 47

<211> 125

<212> PRT

<213> Homo sapiens 5 <400> 47

imagen1

<210> 48

<211> 332 10 <212> ADN

<213> Homo sapiens

<400> 48

imagen1

<210> 49

<211> 112

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 49

<210> 50

<211> 6

<212>: PRT 5 <213> Homo sapiens

imagen1

<400> 50

<210> 51

<211> 17 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 51

imagen1

<210> 52 15 <211> 9

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 52

imagen1

<210> 53

<211> 11

<212> PRT 5 <213> Homo sapiens

<400> 53

<210> 54

<211> 7 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 54

imagen1

<210> 55 15 <211> 9

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 55

20 <210> 56

<211> 288

<212> PRT

<213> Murino

<400> 56

imagen1

<210> 57

<211> 321

<212> ADN 5 <213> Homo sapiens

<400> 57

imagen1

<210> 58

<211> 108 10 <212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 58

imagen1

Claims

REIVINDICACIONES

1. Un anticuerpo aislado o uno de sus fragmentos de unión al antígeno que comprende:

Un dominio VH que comprende 3 CDRs; y un dominio VL que comprende 3 CDRs; en el que el anticuerpo comprende CDRs que tienen las secuencias de:

(a)

SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24 y SEQ ID NO: 25; y SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27 y SEQ ID NO: 28; o

(b)

SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 30 y SEQ ID NO: 31; y SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33 y SEQ ID NO: 34; o

(c)

SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36 y SEQ ID NO: 37 y SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39 y SEQ ID NO: 40; en el que el anticuerpo se une específicamente a un epítopo dentro del dominio extracelular del PD-1 humano.
2.

El anticuerpo de la reivindicación 1 (a) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 6; o el anticuerpo de la reivindicación 1 (b) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 10; o el anticuerpo de la reivindicación 1 (c) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 14.
3.

El anticuerpo de la reivindicación 1 (a), que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 8; o el anticuerpo de la reivindicación 1 (b), que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 12;

o el anticuerpo de la reivindicación 1 (c), que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 16.
4.

El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo se une específicamente al dominio extracelular de PD-1 con una constante de afinidad superior a 107 M-1.
5.

El anticuerpo de la reivindicación 1, donde el anticuerpo inhibe la unión de PD-L a PD-1 con una CI50 inferior a 10 nM.
6.

El anticuerpo de la reivindicación 1, que es una Fab, F(ab')2, Fv, scFv.
7.

El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo es humano.
8.

El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo es IgG1 o IgG4.
9.

El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo es IgG1λ o IgG1κ.
10.

El anticuerpo de la reivindicación 1(a), en el que el anticuerpo comprende un dominio VH de la SEQ ID NO: 6 y un dominio VL de la SEQ ID NO: 8; o el anticuerpo de la reivindicación 1(b) en el que el anticuerpo comprende un dominio VH de la SEQ ID NO: 10 y un dominio VL de la SEQ ID NO: 12; o el anticuerpo de la reivindicación 1(c) en el que el anticuerpo comprende un dominio VH de la SEQ ID NO: 14 y un dominio VL de la SEQ ID NO: 16.
11.

Una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo de la reivindicación 1.
12.

Uso de un anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1-10 anteriores en la preparación de un medicamento.
13.

El uso de la reivindicación 12, en el que el medicamento es para el tratamiento o la prevención de un trastorno seleccionado del grupo constituido por un trastorno autoinmunitario, una respuesta inmunitaria a un injerto, una reacción alérgica, y cáncer.
14.

El uso de la reivindicación 12 ó 13, en el que el medicamento es para su administración a un ser humano.
15.

Un ácido nucleico aislado que codifica el anticuerpo de la reivindicación 1.
16.

Un vector de expresión que comprende el ácido nucleico de la reivindicación 15.
17.

Una célula hospedadora que comprende el vector de la reivindicación 16.
18.

La célula hospedadora de la reivindicación 17, en la que la célula hospedadora se selecciona entre: una bacteria E. coli, una célula de ovario de hámster chino, una célula HeLa, y una célula NS0.
19.

El ácido nucleico de la reivindicación 15, en el que el ácido nucleico codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 6 y SEQ ID NO: 8, o SEQ ID NO: 10 y SEQ ID NO: 12, o SEQ ID NO: 14 y SEQ ID NO: 16.
20.

El ácido nucleico de la reivindicación 19, en el que el ácido nucleico comprende una secuencia de nucleótidos seleccionada del grupo constituido por la SEQ ID NO: 5 y SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9 y SEQ ID NO: 11, o SEQ ID NO: 13 y SEQ ID NO: 15.
21.

Un procedimiento de preparación de un anticuerpo que se une específicamente a un epítopo dentro del dominio extracelular del PD-1 humano, en el que el procedimiento comprende:

(a)

la proporción de un repertorio de partida de ácidos nucleicos que codifican un dominio variable que incluye una CDR3 a reemplazar o que carece de una región que codifica CDR3;

(b)

la combinación del repertorio con un ácido nucleico donador que codifica una secuencia de aminoácidos sustancialmente como se expone en la SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 31, o SEQ ID NO: 37, de manera que el ácido nucleico donador se inserta en la región CDR3 en el repertorio, para así proporcionar un repertorio producto de ácidos nucleicos que codifican un dominio variable;

(c)

la expresión de los ácidos nucleicos del repertorio producto;

(d)

la selección de un fragmento de unión al antígeno que se une específicamente a PD-1; y

(e)

la recuperación del fragmento de unión al antígeno específico o al ácido nucleico que codifica el fragmento de unión.
22.

Un anticuerpo producido mediante el procedimiento de la reivindicación 21.
23.

Uso de un anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10 ó 22 en la fabricación de un medicamento para la modulación de una respuesta inmunitaria adaptativa.
24.

El uso de la reivindicación 23, en el que el medicamento modula una respuesta de células T, células B, o monocitos.
25.

El uso de la reivindicación 23, en el que el anticuerpo es como en la reivindicación 1.
26.

El uso de la reivindicación 23, en el que el anticuerpo es como en la reivindicación 22.
27.

El uso de la reivindicación 23, en el que el anticuerpo está inmovilizado sobre una matriz o reticulado.
28.

El uso de la reivindicación 27, en el que la matriz de soporte comprende uno o más materiales seleccionados entre agarosa, dextrano, celulosa, PVDF, sílice, nailon, dacrón, poliestireno, poliacrilatos, polivinilos, teflones, ácido poliglicólico, polihidroxialcanoato, colágeno, y gelatina.
29.

El uso de la reivindicación 23, en el que el anticuerpo contra PD-1 modula una respuesta celular inmunitaria mediada por una señal de un receptor de antígenos.
30.

El uso de la reivindicación 29, en el que la señal del receptor de antígenos es presentada simultáneamente con el anticuerpo contra PD-1.
31.

El uso de la reivindicación 29, en el que la señal del receptor de antígenos y el anticuerpo contra PD-1 están separadas por no más de 100 µm.
32.

El uso de la reivindicación 29, en el que la señal del receptor de antígenos es proporcionada por un anticuerpo contra CD3.